189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1056 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  100 
 
 		 71 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2844  PhnA protein  79.41 
 
 		 70 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.834334  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  75.34 
 
 		 73 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  76.47 
 
 		 73 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  69.86 
 
 		 73 aa  96.7  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  73.53 
 
 		 70 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  69.12 
 
 		 72 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_004310  BR1463  phnA protein, putative  68.12 
 
 		 69 aa  91.3  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0585  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  67.65 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0725  PhnA protein  69.57 
 
 		 73 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1104  PhnA protein  64.18 
 
 		 99 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1948  PhnA protein  62.69 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707433  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2270  PhnA protein  62.69 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  64.18 
 
 		 101 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1993  PhnA protein  62.69 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  67.16 
 
 		 72 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5247  alkylphosphonate uptake protein  63.64 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7168  PhnA protein  61.19 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  65.67 
 
 		 72 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1830  PhnA protein  58.82 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0790585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  66.67 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5393  PhnA-like protein  60.29 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6324  PhnA protein  61.54 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.862401  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6145  PhnA protein  68.12 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0216  PhnA domain-containing protein  64.71 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5170  PhnA-like protein  58.82 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00732124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  60.87 
 
 		 72 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0195  PhnA domain-containing protein  65.67 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0178  PhnA domain-containing protein  65.67 
 
 		 69 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  63.38 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0010  conserved hypothetical protein, PhnA family  62.69 
 
 		 69 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  58.82 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  58.82 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6162  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.82 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1275  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.82 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6554  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.82 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6556  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.82 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0933451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6268  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.82 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940336  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7062  PhnA protein  58.82 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225206  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1747  PhnA protein  58.82 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0953769  normal  0.26972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.82 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  61.19 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1028  hypothetical protein  56.72 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000970664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  61.19 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  61.19 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  61.19 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  61.19 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  61.19 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  61.19 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.82 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1476  PhnA protein  58.57 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  61.19 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  61.19 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  59.7 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.94 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  59.7 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.88 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.88 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.82 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  59.7 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.21 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3850  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  60.29 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  59.7 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  59.7 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.7 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1254  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  60.29 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0192046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.35 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.09 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  59.7 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  55.22 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.21 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  54.41 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0976  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.7 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  58.82 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0099  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.88 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3334  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.7 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4249  putative Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism, PhnA-like protein  54.17 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435311  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18100  PhnA protein  55.88 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  54.41 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.88 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.678342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  52.94 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.82 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  54.41 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  58.21 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1492  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.21 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.301207  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0904  PhnA-like protein  55.88 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000773889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1380  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.21 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0311  hypothetical protein  58.21 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0235836 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.72 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  54.41 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  54.41 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.72 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4862  PhnA protein  56.72 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.72 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.72 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.73 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.72 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.72 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  50 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4848  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.73 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.421642 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>