47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1052 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 		 365 aa  729    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  51.11 
 
 		 357 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  50.28 
 
 		 357 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  46.99 
 
 		 358 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  45.75 
 
 		 355 aa  298  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  35.23 
 
 		 239 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  34.72 
 
 		 239 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  33.33 
 
 		 239 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  34.18 
 
 		 231 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  34.18 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  32.29 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  25.71 
 
 		 563 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0060  phospholipase/carboxylesterase  32.65 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.885579  normal  0.31865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4055  phospholipase/carboxylesterase  30.41 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.342724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6756  phospholipase/carboxylesterase  28.42 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  26.8 
 
 		 238 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  30.58 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3855  phospholipase/Carboxylesterase  30.35 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4173  phospholipase/carboxylesterase  26.86 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  21.89 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  21.39 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  22.22 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  26.21 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  29.47 
 
 		 227 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  25.64 
 
 		 277 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  25.71 
 
 		 316 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  23.78 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.97 
 
 		 313 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  28.76 
 
 		 260 aa  49.7  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  28.43 
 
 		 261 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1822  hypothetical protein  30.48 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  23 
 
 		 276 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0972  phospholipase/carboxylesterase  30.71 
 
 		 218 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  33.06 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  28.97 
 
 		 325 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  24.02 
 
 		 237 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.7 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  33.1 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  32.93 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0353  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  37.88 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  26.02 
 
 		 461 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  23.16 
 
 		 218 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  27.88 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  32.23 
 
 		 367 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  22.83 
 
 		 468 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  27.82 
 
 		 270 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>