274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0988 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 
284 aa  590  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  69.37 
 
 
287 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  38.25 
 
 
308 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  37.5 
 
 
295 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  37.32 
 
 
299 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  37.5 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  36.52 
 
 
299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  36.52 
 
 
299 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  36.33 
 
 
291 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  37 
 
 
273 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  35.97 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  35.97 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.62 
 
 
298 aa  178  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  35.97 
 
 
308 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  35.42 
 
 
300 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  35.92 
 
 
299 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  35.71 
 
 
298 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  36.24 
 
 
299 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  35.76 
 
 
300 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  35.07 
 
 
301 aa  175  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  34.4 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  35.61 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  35.61 
 
 
308 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  34.56 
 
 
302 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  35.29 
 
 
304 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  34.72 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  34.04 
 
 
297 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  34.04 
 
 
297 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  34.04 
 
 
297 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  34.04 
 
 
297 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  34.04 
 
 
297 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  34.04 
 
 
297 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  34.81 
 
 
296 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.53 
 
 
287 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  33.45 
 
 
305 aa  155  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  33.57 
 
 
285 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  33.57 
 
 
335 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  33.57 
 
 
277 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  36.21 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  35 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  32.86 
 
 
277 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  33.21 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0131  TauD/TfdA family dioxygenase  31.25 
 
 
327 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  30.9 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  30.9 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  32.16 
 
 
277 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.1 
 
 
288 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2171  TauD/TfdA family dioxygenase  30.47 
 
 
292 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0808968  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0908  TauD/TfdA family dioxygenase  30.47 
 
 
283 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0747691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0816  TauD/TfdA family dioxygenase  30.47 
 
 
283 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  32.16 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  33.81 
 
 
276 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  30.63 
 
 
277 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  32.87 
 
 
283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  30.63 
 
 
277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  30.66 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  32.87 
 
 
283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  32.87 
 
 
283 aa  135  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  32.87 
 
 
283 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  32.87 
 
 
283 aa  135  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  32.87 
 
 
283 aa  135  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  32.87 
 
 
283 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  30 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  32.53 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  33.1 
 
 
278 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  30.04 
 
 
277 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  29.68 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  32.86 
 
 
322 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  32.08 
 
 
301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  32.28 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5979  Taurine dioxygenase  31.88 
 
 
290 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0297  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.56 
 
 
282 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.849984  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2123  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.73 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0464  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.57 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  30.56 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6965  Alpha-ketoglutarate-dependent 2,4-dichlorophenoxyacetate dioxygenase  33.45 
 
 
295 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3050  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.99 
 
 
294 aa  126  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  38.12 
 
 
307 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  32.16 
 
 
304 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53191  predicted protein  29.93 
 
 
378 aa  124  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4466  TauD/TfdA family dioxygenase  30.47 
 
 
290 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.038749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  30.82 
 
 
270 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.9 
 
 
304 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  29.54 
 
 
282 aa  122  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  29.54 
 
 
282 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  29.54 
 
 
282 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2155  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  32.8 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  29.41 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  30.47 
 
 
264 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  30.58 
 
 
267 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  30.8 
 
 
308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1161  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.6 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00427132  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.72 
 
 
305 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  28.18 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  30.6 
 
 
315 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1633  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.96 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  31.99 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.27 
 
 
321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  29.39 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  29.07 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>