More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0980 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 300 aa  593  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  35.71 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  34.1 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  34 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  30.83 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  27.33 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  30.22 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2848  ketohexokinase  27.52 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  34.15 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  28.95 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  27.37 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  30.96 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0921  ketohexokinase  31.12 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  29.96 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  24.75 
 
 		 288 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  29.78 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  33.57 
 
 		 310 aa  86.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  31.43 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  31.43 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  31.43 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  31.43 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  31.43 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  30.04 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  30.1 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  25.79 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  31.43 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  31.07 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  30.4 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  26.07 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  30.71 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  30.71 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  25 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  30.71 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  30.71 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  29.41 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  28.9 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  25.17 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  22.86 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  22.86 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  30.72 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  30.42 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  30.72 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  30.72 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  25.17 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  28.37 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235286 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  28.37 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  30.31 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  30.36 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36053  predicted protein  31.49 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.630596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  29.43 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  32.33 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  28.72 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  29.12 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  27.08 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  32.45 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2455  PfkB domain-containing protein  31.29 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.287722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  28.97 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  29.21 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  31.48 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  29.6 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  32.47 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  31.15 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  32.05 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2311  ribokinase-like domain-containing protein  27.39 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  28.53 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  26.64 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  30.3 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  23.05 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  31.21 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  29.53 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  32.6 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  31.69 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  30.55 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1314  PfkB domain protein  32.71 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  28.72 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.83 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0029  Ketohexokinase  27.24 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.892362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  28.01 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  28.78 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  29.05 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  32.14 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  29.74 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5220  PfkB domain protein  27.48 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.946183  normal  0.655823 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  29.97 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  28.89 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  28.68 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  32.12 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  31.32 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  31.85 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  29.41 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  31.1 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  28.68 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  28.68 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  31.56 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  30.68 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  28.04 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.1 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>