27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0876 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0876  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.878861  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1941  hypothetical protein  53.53 
 
 
200 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0327741  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3518  hypothetical protein  55.29 
 
 
198 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2060  DNA replication initiation ATPase  54.71 
 
 
203 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2226  DNA replication initiation ATPase  53.33 
 
 
330 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000024836  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0072  hypothetical protein  57.55 
 
 
180 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1776  hypothetical protein  50.87 
 
 
213 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0182975  normal  0.0433353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0874  hypothetical protein  46.59 
 
 
272 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0473235  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4956  hypothetical protein  50 
 
 
282 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0505  hypothetical protein  49.08 
 
 
275 aa  142  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0199064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0468  hypothetical protein  47.47 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.218243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0434  hypothetical protein  45.57 
 
 
280 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.953981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2225  hypothetical protein  46.84 
 
 
376 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0551964  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1483  hypothetical protein  36.9 
 
 
378 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2687  hypothetical protein  49.31 
 
 
263 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304956  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6073  hypothetical protein  36.06 
 
 
378 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0573  hypothetical protein  52.17 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1533  hypothetical protein  37.4 
 
 
379 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.796419 
 
 
-
 
NC_004310  BR0572  hypothetical protein  52.17 
 
 
214 aa  128  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1584  hypothetical protein  35.63 
 
 
374 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16808  normal  0.0492806 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2069  hypothetical protein  50 
 
 
157 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1289  hypothetical protein  38.95 
 
 
283 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1378  hypothetical protein  40.12 
 
 
384 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1710  hypothetical protein  47.79 
 
 
188 aa  98.2  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.385544  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1372  hypothetical protein  35.51 
 
 
348 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396707  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1204  hypothetical protein  42.86 
 
 
237 aa  92.8  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.843488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0895  hypothetical protein  36.75 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610672  normal  0.201664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>