25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0864 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0864  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 380 aa  748    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.109477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  33.51 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  30.2 
 
 		 363 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  29.58 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  28.17 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  27.78 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  32.4 
 
 		 352 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  30.42 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  30 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  23.85 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  30.62 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  27.4 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  27.4 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  30.92 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  27.27 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  24.64 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  27 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  26.65 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  25.55 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  23.91 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  24.12 
 
 		 371 aa  50.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  27.75 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0494  saccharopine dehydrogenase  31.16 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  28.68 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2697  hypothetical protein  30.99 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>