66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0852 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 265 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  42.11 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.96 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.32 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  32.03 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.93 
 
 		 285 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  30.77 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.3 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  30.95 
 
 		 291 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  28.51 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.67 
 
 		 287 aa  92.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  32.12 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  25.93 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.64 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.02 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.47 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  29.76 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  26.16 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  27.65 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  21.81 
 
 		 259 aa  72  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.16 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.16 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.05 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.76 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.8 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.06 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2701  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.39 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.63 
 
 		 292 aa  62  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.67 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.65 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1088  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.88 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.326612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  23.94 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.39 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.6 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.79 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.46 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.48 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  23.22 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  29.09 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00615  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03330)  27.27 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.25 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.83 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1417  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.3 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.82 
 
 		 320 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.42 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  22.79 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.05 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.09 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46716  predicted protein  29.01 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.269942  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00020  expressed protein  22.49 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.79 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.4 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41583  predicted protein  26.09 
 
 		 432 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.531916  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 		 270 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 		 285 aa  45.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.5 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.87 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.28 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  27.54 
 
 		 320 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2632  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.13 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.275441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7669  esterase/lipase/thioesterase  29.57 
 
 		 348 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02616  lipase signal peptide protein  28.7 
 
 		 339 aa  42.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6063  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.57 
 
 		 344 aa  42  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3446  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.06 
 
 		 339 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>