272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0828 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  100 
 
 		 276 aa  576  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  46.07 
 
 		 278 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  43.54 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  42.48 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  40.07 
 
 		 277 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  41.97 
 
 		 277 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  41.18 
 
 		 277 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  40.07 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  42.39 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  40.07 
 
 		 277 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  41.58 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  40.07 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3893  Taurine dioxygenase  41.79 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  41.79 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  41.84 
 
 		 293 aa  201  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  40.22 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  42.03 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  44.78 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  41.37 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  41.3 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  38.27 
 
 		 280 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  41.16 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  40.78 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  41.07 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  39.93 
 
 		 299 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  41.22 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  39.13 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  41.43 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  42.18 
 
 		 273 aa  195  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  39.11 
 
 		 306 aa  195  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  40.21 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  41.16 
 
 		 287 aa  195  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  40.22 
 
 		 299 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  41.11 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  39.93 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  41.11 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  39.56 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  40.65 
 
 		 300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  41.11 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  41.11 
 
 		 308 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  40.86 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  39.51 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  39.19 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  39.19 
 
 		 277 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  38.78 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  38.55 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  38.78 
 
 		 283 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  38.55 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  38.78 
 
 		 283 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  40 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  38.78 
 
 		 283 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  38.78 
 
 		 283 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5979  Taurine dioxygenase  37.45 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  38.83 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  38.17 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  37.92 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  37.92 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  37.92 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  40.81 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  37.13 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  37.72 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  38.18 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  36.88 
 
 		 264 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.36 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  38.85 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  39.63 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  38.13 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  36.52 
 
 		 264 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  38.77 
 
 		 292 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  38.77 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  38.77 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  38.77 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  36.8 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  38.77 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  38.77 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  38.77 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  38.52 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  38.41 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  36.64 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  39.36 
 
 		 304 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  37.45 
 
 		 289 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  39.72 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  36.53 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  38.46 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  37.1 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  36.26 
 
 		 282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  38.46 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  37.94 
 
 		 318 aa  168  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  37.06 
 
 		 280 aa  168  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  36.93 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  36.62 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  35.79 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  35.91 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  36.97 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  36.49 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  36.49 
 
 		 309 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  36.62 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4891  taurine dioxygenase  35.51 
 
 		 273 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3279  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  36.23 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  36.49 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>