More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0810 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
269 aa  541  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  56.92 
 
 
265 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 
257 aa  174  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.16 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.26 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.54 
 
 
271 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.02 
 
 
271 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 
259 aa  168  9e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
274 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 
260 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 
260 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 
266 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
294 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
266 aa  158  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 
292 aa  158  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
268 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.88 
 
 
659 aa  157  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.26 
 
 
267 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
262 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
264 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
265 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
287 aa  155  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.07 
 
 
264 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 
265 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.7 
 
 
259 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
287 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  36.05 
 
 
663 aa  152  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 
267 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
264 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.74 
 
 
662 aa  152  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
266 aa  152  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.55 
 
 
662 aa  152  7e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  39.53 
 
 
661 aa  152  7e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
259 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
264 aa  152  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  36.57 
 
 
262 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.98 
 
 
293 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 
263 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 
263 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
262 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 
263 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
296 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
262 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 
260 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  36.67 
 
 
263 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
270 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
262 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
262 aa  148  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
257 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 
262 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 
262 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 
296 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.02 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.46 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
262 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 
259 aa  146  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
264 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
262 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 
252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1409  naphthoate synthase  35.27 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  35.96 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 
267 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
258 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.5 
 
 
278 aa  145  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
263 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
263 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
260 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 
282 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 
256 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
262 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
260 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
263 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
263 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
295 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
263 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
263 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
263 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
263 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.17 
 
 
261 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
262 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
263 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
260 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>