More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0733 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 537 aa  1047    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  60.69 
 
 		 532 aa  592  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  63.49 
 
 		 534 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  62.97 
 
 		 540 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  61.72 
 
 		 539 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  61.19 
 
 		 538 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  58.35 
 
 		 532 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  51.82 
 
 		 531 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  53.75 
 
 		 521 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2362  L-aspartate oxidase  53.67 
 
 		 532 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  48.57 
 
 		 516 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  51.33 
 
 		 509 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  52.93 
 
 		 509 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  48.84 
 
 		 517 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  50.51 
 
 		 509 aa  412  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  50.61 
 
 		 519 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  50 
 
 		 517 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  46.42 
 
 		 512 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.75 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  48.19 
 
 		 522 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  49.6 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  40.12 
 
 		 532 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  51.87 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  47.89 
 
 		 509 aa  385  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  48.72 
 
 		 518 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  48.46 
 
 		 506 aa  385  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0790  L-aspartate oxidase  48.75 
 
 		 547 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0247057 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  45.16 
 
 		 512 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  49.8 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1182  L-aspartate oxidase  48.02 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  52.56 
 
 		 506 aa  365  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  45.23 
 
 		 867 aa  359  9e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  51.46 
 
 		 507 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  40.43 
 
 		 535 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  47.73 
 
 		 502 aa  356  5.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  40.35 
 
 		 534 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  46.02 
 
 		 572 aa  352  7e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  38.86 
 
 		 538 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  45.35 
 
 		 545 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  39.22 
 
 		 532 aa  348  9e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  42.33 
 
 		 529 aa  347  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  45.47 
 
 		 548 aa  347  3e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  41.78 
 
 		 515 aa  347  4e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  42.55 
 
 		 515 aa  346  5e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  38.86 
 
 		 542 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  44.49 
 
 		 566 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  44.12 
 
 		 557 aa  344  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  42.5 
 
 		 507 aa  342  8e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  42.43 
 
 		 541 aa  342  9e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  43.45 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  43.11 
 
 		 863 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  44.82 
 
 		 847 aa  341  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  41.59 
 
 		 522 aa  336  7e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01711  L-aspartate oxidase  37.43 
 
 		 566 aa  335  9e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.507615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1468  L-aspartate oxidase  37.24 
 
 		 566 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  44.38 
 
 		 575 aa  334  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  39.57 
 
 		 543 aa  334  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  40.48 
 
 		 577 aa  333  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  39.39 
 
 		 533 aa  333  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  43.05 
 
 		 538 aa  333  5e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02181  L-aspartate oxidase  39.96 
 
 		 556 aa  333  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  39.92 
 
 		 545 aa  330  3e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  37.76 
 
 		 531 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  40.04 
 
 		 539 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  38.43 
 
 		 531 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  40.62 
 
 		 556 aa  329  6e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  37.45 
 
 		 519 aa  329  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2335  L-aspartate oxidase  41.14 
 
 		 552 aa  329  6e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  40.43 
 
 		 539 aa  329  9e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 		 558 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01151  L-aspartate oxidase  37.73 
 
 		 555 aa  329  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01161  L-aspartate oxidase  37.8 
 
 		 555 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  38.63 
 
 		 531 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  40.5 
 
 		 513 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  44.31 
 
 		 572 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  41.28 
 
 		 538 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  41.28 
 
 		 538 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  45.36 
 
 		 549 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  39.42 
 
 		 540 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0104  L-aspartate oxidase  37.78 
 
 		 555 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  38.39 
 
 		 531 aa  324  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  39.61 
 
 		 540 aa  324  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  36.29 
 
 		 509 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  38.25 
 
 		 516 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  39.61 
 
 		 540 aa  323  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  40.04 
 
 		 534 aa  323  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  38.27 
 
 		 565 aa  323  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  39.42 
 
 		 540 aa  322  8e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  39.42 
 
 		 540 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  39.42 
 
 		 540 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  39.84 
 
 		 533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  39.84 
 
 		 545 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  39.84 
 
 		 533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  38.91 
 
 		 528 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  37.98 
 
 		 571 aa  320  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  39.22 
 
 		 540 aa  320  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  40.89 
 
 		 533 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  40.89 
 
 		 533 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  37.33 
 
 		 537 aa  319  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>