218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0706 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
101 aa  210  6e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  71.58 
 
 
95 aa  148  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  66.32 
 
 
107 aa  135  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  60 
 
 
95 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  63.33 
 
 
95 aa  120  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  56.52 
 
 
100 aa  118  2e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  56.84 
 
 
95 aa  118  2e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  60 
 
 
109 aa  116  1e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  56.18 
 
 
95 aa  115  2e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  56.67 
 
 
102 aa  114  4e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  55.56 
 
 
96 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  60.67 
 
 
99 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  56.18 
 
 
95 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  56.84 
 
 
95 aa  113  1e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  57.3 
 
 
95 aa  112  2e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  61.54 
 
 
95 aa  111  4e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.13 
 
 
95 aa  110  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  60 
 
 
114 aa  110  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  49.49 
 
 
110 aa  108  2e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  53 
 
 
111 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  61.11 
 
 
118 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  54.95 
 
 
98 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  52.63 
 
 
130 aa  108  4e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  57.65 
 
 
95 aa  107  4e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.93 
 
 
95 aa  108  4e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  53.26 
 
 
110 aa  107  4e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  50.53 
 
 
95 aa  107  7e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  56.67 
 
 
96 aa  106  8e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  54.55 
 
 
118 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  54.55 
 
 
118 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  54.55 
 
 
118 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  51.65 
 
 
119 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  51.14 
 
 
97 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  52.22 
 
 
96 aa  103  8e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  52.22 
 
 
96 aa  103  8e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  55.06 
 
 
102 aa  102  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  51.58 
 
 
95 aa  102  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  53.41 
 
 
113 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  55.29 
 
 
95 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  56.82 
 
 
101 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  52.33 
 
 
96 aa  100  7e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  49.46 
 
 
100 aa  100  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  50.55 
 
 
95 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.33 
 
 
96 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  47.78 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  52.17 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  47.37 
 
 
99 aa  99  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  53.93 
 
 
95 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  54.76 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  51.69 
 
 
100 aa  98.2  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  52.22 
 
 
96 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  52.81 
 
 
95 aa  97.1  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 
104 aa  97.1  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  49.44 
 
 
98 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  44.21 
 
 
125 aa  92  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  45.83 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  4.08802e-05  hitchhiker  5.27007e-05 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.75 
 
 
97 aa  90.9  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  8.20325e-08  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  46.15 
 
 
100 aa  90.1  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  48.31 
 
 
97 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  48.31 
 
 
97 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  48.31 
 
 
97 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  48.31 
 
 
97 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  48.31 
 
 
97 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  48.31 
 
 
97 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  49.4 
 
 
100 aa  89  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  48.31 
 
 
97 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  48.31 
 
 
97 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  48.31 
 
 
97 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  46.07 
 
 
95 aa  88.2  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  46.07 
 
 
121 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  46.43 
 
 
98 aa  84.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  45.88 
 
 
113 aa  82.8  1e-15  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  41.57 
 
 
107 aa  82.4  2e-15  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  44.44 
 
 
96 aa  82  2e-15  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  55.06 
 
 
98 aa  82  3e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.39 
 
 
99 aa  80.1  9e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  49.32 
 
 
80 aa  80.1  1e-14  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  40.66 
 
 
101 aa  70.9  6e-12  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4036  hypothetical protein  47.69 
 
 
79 aa  65.9  2e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.25 
 
 
88 aa  65.5  3e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  3.59134e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11350  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.51 
 
 
87 aa  61.6  3e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.651931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 
141 aa  62  3e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  41.98 
 
 
88 aa  61.2  5e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  38.2 
 
 
90 aa  60.1  9e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  42.31 
 
 
103 aa  58.5  3e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  42.11 
 
 
94 aa  58.2  4e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  38.55 
 
 
91 aa  58.2  4e-08  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  43.04 
 
 
108 aa  57.8  5e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  42.25 
 
 
119 aa  57.8  5e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  37.18 
 
 
83 aa  57.4  7e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0980  GIY-YIG nuclease superfamily protein  34.52 
 
 
100 aa  57.4  7e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  42.11 
 
 
106 aa  56.2  1e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  42.11 
 
 
67 aa  56.6  1e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.29 
 
 
166 aa  56.6  1e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.71 
 
 
88 aa  55.8  2e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.81458e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.65 
 
 
103 aa  55.5  2e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.65 
 
 
103 aa  55.5  2e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1913  hypothetical protein  31.11 
 
 
116 aa  55.5  2e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.915766  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  32.97 
 
 
96 aa  54.7  4e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  37.21 
 
 
140 aa  55.1  4e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>