More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0671 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 318 aa  626  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  62.09 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  61.72 
 
 		 316 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  66.32 
 
 		 315 aa  361  8e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  60.4 
 
 		 316 aa  360  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  62.42 
 
 		 313 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  63.09 
 
 		 313 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  58.61 
 
 		 312 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  59.79 
 
 		 315 aa  349  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  57.33 
 
 		 315 aa  348  8e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  57.33 
 
 		 312 aa  348  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  61.11 
 
 		 328 aa  345  6e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  61.11 
 
 		 328 aa  345  6e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  59.72 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  60.27 
 
 		 353 aa  342  5e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  60.55 
 
 		 312 aa  341  9e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  61.59 
 
 		 310 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  60.34 
 
 		 313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  61.13 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  57.61 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  61.96 
 
 		 312 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  58.57 
 
 		 345 aa  322  6e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  56.7 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  58.62 
 
 		 304 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  56.27 
 
 		 305 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  54.51 
 
 		 311 aa  309  4e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  54.18 
 
 		 295 aa  308  9e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  58.96 
 
 		 317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  58.96 
 
 		 317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  56.83 
 
 		 328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  54.17 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  54.17 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  58.48 
 
 		 316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  58.31 
 
 		 317 aa  305  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  58.63 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  55.52 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  51.74 
 
 		 313 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  54.77 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  57.19 
 
 		 302 aa  299  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  52.76 
 
 		 302 aa  298  1e-79  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  59.42 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  53.31 
 
 		 317 aa  296  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  50.17 
 
 		 295 aa  296  3e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  54.81 
 
 		 310 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  52.98 
 
 		 330 aa  293  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  51.12 
 
 		 295 aa  279  4e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  48.78 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  45.8 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  41.61 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  43.73 
 
 		 534 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  41.61 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  41.88 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  44.37 
 
 		 535 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  42.52 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  42.47 
 
 		 301 aa  225  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  42.41 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  44.78 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  45.05 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  42.07 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  43.58 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  38.44 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  44.12 
 
 		 298 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  44.44 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  47.96 
 
 		 309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  41.08 
 
 		 299 aa  222  8e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  44.9 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  46.02 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  43.36 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  42.47 
 
 		 301 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  43.23 
 
 		 310 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  45.26 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  42.44 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  45.04 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  44.33 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  45.04 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  44.33 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  45.26 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  44.33 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  44.33 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  44.33 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  41.83 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  45.26 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  44.33 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  44.33 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  45.26 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  44.33 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  43.17 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  46.08 
 
 		 443 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  43.38 
 
 		 312 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  43.96 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  43.1 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  43.4 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  43.71 
 
 		 305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  43.1 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  43.4 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  45.49 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  41.81 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  43.34 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  44.14 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>