More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0604 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  46.07 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  44.69 
 
 		 218 aa  147  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  39.38 
 
 		 216 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0437  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  33.16 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5222  transcriptional regulator  29.07 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  50.7 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  55.74 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  55.74 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  45.68 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  49.18 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  43.9 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  34.19 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  36.63 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  42.55 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 74 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  35.71 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>