More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0592 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4054  isocitrate lyase  74.31 
 
 		 492 aa  670    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0816  isocitrate lyase  72.54 
 
 		 429 aa  656    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.745785  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0308  isocitrate lyase  73.24 
 
 		 429 aa  663    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1614  isocitrate lyase  74.18 
 
 		 429 aa  665    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.642543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2985  isocitrate lyase  78.97 
 
 		 435 aa  700    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.54257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0405  isocitrate lyase  71.36 
 
 		 429 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156057 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3930  isocitrate lyase  72.54 
 
 		 429 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0373  isocitrate lyase  72.54 
 
 		 429 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432855  hitchhiker  0.00124435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1097  isocitrate lyase  78.55 
 
 		 435 aa  706    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0592  isocitrate lyase  100 
 
 		 432 aa  897    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442111  normal  0.573655 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1558  isocitrate lyase  74.65 
 
 		 429 aa  672    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0311  isocitrate lyase  72.07 
 
 		 429 aa  657    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.251887  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1625  isocitrate lyase  78.01 
 
 		 428 aa  679    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270498  normal  0.451985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0040  isocitrate lyase  71.22 
 
 		 426 aa  600  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1229  isocitrate lyase  69.66 
 
 		 425 aa  592  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1027  isocitrate lyase  69.66 
 
 		 425 aa  591  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.156161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1480  isocitrate lyase  69.25 
 
 		 428 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1287  isocitrate lyase  69.66 
 
 		 425 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000193732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1052  isocitrate lyase  69.42 
 
 		 425 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1030  isocitrate lyase  69.42 
 
 		 425 aa  590  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0665  isocitrate lyase  68.52 
 
 		 428 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000467053  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1132  isocitrate lyase  69.42 
 
 		 425 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00988678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1210  isocitrate lyase  69.42 
 
 		 425 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  67.95 
 
 		 1110 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1033  isocitrate lyase  68.69 
 
 		 425 aa  587  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00237406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1182  isocitrate lyase  69.17 
 
 		 425 aa  587  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00317473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4157  isocitrate lyase  69.17 
 
 		 425 aa  587  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0289432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1501  isocitrate lyase  65.4 
 
 		 461 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  67.95 
 
 		 1111 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  67.71 
 
 		 1111 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1017  isocitrate lyase  66.9 
 
 		 430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0854  isocitrate lyase  68.2 
 
 		 425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00269898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1865  isocitrate lyase  67.87 
 
 		 430 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  67.39 
 
 		 1111 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1287  isocitrate lyase  66.1 
 
 		 443 aa  577  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.745788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28360  isocitrate lyase  67.07 
 
 		 432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.721222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1377  isocitrate lyase  67.72 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228552  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0698  isocitrate lyase  65.37 
 
 		 435 aa  567  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2249  isocitrate lyase  65.85 
 
 		 428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.44014  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1009  isocitrate lyase  64.15 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0028  isocitrate lyase  65.86 
 
 		 427 aa  560  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2006  isocitrate lyase  65.14 
 
 		 422 aa  558  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1385  isocitrate lyase  65.12 
 
 		 431 aa  558  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2490  isocitrate lyase  65.37 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000238202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1429  isocitrate lyase  64.98 
 
 		 432 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2486  isocitrate lyase  65.78 
 
 		 434 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  hitchhiker  0.000410073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3449  putative isocitrate lyase  66.35 
 
 		 430 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0890897  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1961  isocitrate lyase  63.66 
 
 		 431 aa  551  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1651  isocitrate lyase  65.54 
 
 		 434 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232298  normal  0.0282677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0768  isocitrate lyase  64.15 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.139053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2067  isocitrate lyase  64.34 
 
 		 435 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1229  isocitrate lyase  64.34 
 
 		 435 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19821 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6029  isocitrate lyase  64.34 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2048  isocitrate lyase  64.34 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1950  isocitrate lyase  63.86 
 
 		 435 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8838  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02080  isocitrate lyase  63.37 
 
 		 435 aa  544  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5357  isocitrate lyase  64.1 
 
 		 435 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4375  isocitrate lyase  64.15 
 
 		 428 aa  541  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2080  isocitrate lyase  63.86 
 
 		 435 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250902  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0189  isocitrate lyase  63.9 
 
 		 433 aa  541  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0259015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0711  isocitrate lyase  63.13 
 
 		 438 aa  541  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2088  isocitrate lyase  63.86 
 
 		 475 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00747543  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1998  isocitrate lyase  64.1 
 
 		 435 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4164  isocitrate lyase  63.9 
 
 		 428 aa  538  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.652432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3224  isocitrate lyase  63.86 
 
 		 475 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0583  isocitrate lyase  62.44 
 
 		 443 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5339  isocitrate lyase  63.61 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641563  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2470  isocitrate lyase  63.86 
 
 		 435 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1586  isocitrate lyase  63.86 
 
 		 435 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0742206  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2613  isocitrate lyase  63.86 
 
 		 435 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2524  isocitrate lyase  63.86 
 
 		 435 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1402  isocitrate lyase  62.44 
 
 		 422 aa  535  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1368  isocitrate lyase  63.13 
 
 		 434 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.871931  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1361  isocitrate lyase  63.86 
 
 		 435 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2063  isocitrate lyase  62.68 
 
 		 426 aa  532  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1358  isocitrate lyase  61.78 
 
 		 443 aa  529  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.355427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0073  isocitrate lyase  61.41 
 
 		 452 aa  525  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.136709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1232  isocitrate lyase  62.2 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635123  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0923  isocitrate lyase  63.02 
 
 		 442 aa  526  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1295  isocitrate lyase  62.2 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0485225  normal  0.330509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10474  isocitrate lyase icl  62.29 
 
 		 428 aa  527  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3668  isocitrate lyase  61.74 
 
 		 430 aa  519  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0801  isocitrate lyase  61.56 
 
 		 428 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0763  isocitrate lyase  61.35 
 
 		 431 aa  519  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0107  isocitrate lyase  61.8 
 
 		 428 aa  521  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19864  normal  0.815219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0629  isocitrate lyase  61.31 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0636  isocitrate lyase  61.31 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1869  isocitrate lyase  61.19 
 
 		 439 aa  514  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.612764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0649  isocitrate lyase  61.31 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.966467 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1276  isocitrate lyase  61.43 
 
 		 450 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2855  isocitrate lyase  60.34 
 
 		 439 aa  508  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6438  isocitrate lyase  59.95 
 
 		 443 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1335  isocitrate lyase  60.24 
 
 		 439 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2101  isocitrate lyase  60 
 
 		 439 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0829587 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2766  isocitrate lyase  60.71 
 
 		 440 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0008216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2844  isocitrate lyase  60.48 
 
 		 440 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2942  isocitrate lyase  60.71 
 
 		 440 aa  511  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.337122  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1484  isocitrate lyase  60.24 
 
 		 440 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1239  isocitrate lyase  60.48 
 
 		 440 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.18616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1246  isocitrate lyase  61.19 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0481368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>