More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0533 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 234 aa  118  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 214 aa  117  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 217 aa  115  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  31.44 
 
 		 251 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  32.29 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.1 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  32.81 
 
 		 230 aa  98.6  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  30.2 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 220 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 215 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  30.66 
 
 		 224 aa  93.2  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 225 aa  91.7  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 222 aa  91.3  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  33 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  30.96 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  35.5 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 215 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 248 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  29.56 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 220 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  29.74 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 192 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  29.5 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6489  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  28.28 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  29.23 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
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NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
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NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
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NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
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NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
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