50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0507 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0507  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  100 
 
 		 338 aa  687    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  26.79 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  30.15 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  25.6 
 
 		 558 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  27.61 
 
 		 522 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  25.9 
 
 		 558 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  27.13 
 
 		 541 aa  72.8  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  27.52 
 
 		 525 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  25.69 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  27.52 
 
 		 521 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 		 521 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  24.4 
 
 		 536 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  24 
 
 		 532 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  27.13 
 
 		 869 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  24.83 
 
 		 638 aa  66.2  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  26.97 
 
 		 533 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  23.94 
 
 		 541 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  23.72 
 
 		 538 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 		 531 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  23.11 
 
 		 535 aa  59.7  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 885 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 919 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 		 899 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 		 895 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  25.49 
 
 		 863 aa  57  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.78 
 
 		 842 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  23.97 
 
 		 540 aa  56.6  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 		 863 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 889 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 		 889 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 831 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  25.49 
 
 		 895 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 		 868 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03727  putative beta transglucosylase, GH17 family (Eurofung)  24.06 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 		 862 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  23.9 
 
 		 863 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 859 aa  52.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  22.31 
 
 		 650 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 		 863 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 		 903 aa  50.8  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10150  Putative beta-transglucosylase. Family GH17. A fumigatus Bgt1-like (Eurofung)  21.58 
 
 		 304 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251061  normal  0.119691 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  26.44 
 
 		 529 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 		 889 aa  47  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89695  Soluble Cell Wall protein  25.13 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00660  glucan 1,3 beta-glucosidase protein putative  26.07 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 917 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.4 
 
 		 1290 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  20.27 
 
 		 555 aa  43.5  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>