More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0472 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0472  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
322 aa  654    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3349  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.27 
 
 
316 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.399872  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3153  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.27 
 
 
316 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.566482  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3477  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  51.27 
 
 
316 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1452  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.44 
 
 
318 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0540  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  52.52 
 
 
318 aa  315  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3261  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  50.95 
 
 
316 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4532  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  50.63 
 
 
316 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.472069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4781  hypothetical protein  37.25 
 
 
337 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4330  hypothetical protein  38.27 
 
 
297 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5823  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.25 
 
 
320 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2239  esterase/lipase/thioesterase  36.86 
 
 
322 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.58 
 
 
292 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2712  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  51.85 
 
 
229 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149419  normal  0.0838365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.35 
 
 
314 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.94 
 
 
310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.57 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.57 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  33.45 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  31.19 
 
 
317 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.65 
 
 
301 aa  125  7e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.97 
 
 
325 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.96 
 
 
312 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.27 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.11 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.61 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0552  acetyl esterase  28.33 
 
 
323 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  34.8 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.06 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.33 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1347  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.45 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0536  acetyl esterase  28.33 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1891  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.47 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0517775  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0542  acetyl esterase  27.92 
 
 
323 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0537  acetyl esterase  27.92 
 
 
323 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.19 
 
 
382 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.51 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  34.14 
 
 
311 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2159  hypothetical protein  31.82 
 
 
444 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.14 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.33 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.04 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.16 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  30.82 
 
 
346 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.69 
 
 
313 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.62 
 
 
317 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.47 
 
 
311 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4350  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.57 
 
 
333 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00963148  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.33 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.6 
 
 
316 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1549  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.62 
 
 
315 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149777  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.4 
 
 
317 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.16 
 
 
317 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1944  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.41 
 
 
321 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.08 
 
 
337 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2888  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.48 
 
 
315 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.564555  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0514  acetyl esterase  25.66 
 
 
319 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3243  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.23 
 
 
326 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.96 
 
 
311 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0553  acetyl esterase  25.82 
 
 
319 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3140  acetyl esterase  25.82 
 
 
319 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.848607  hitchhiker  0.00168444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1786  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.44 
 
 
317 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  hitchhiker  0.00646519 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.27 
 
 
310 aa  106  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.67 
 
 
311 aa  105  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.64 
 
 
318 aa  105  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00427  acetyl esterase  25.82 
 
 
319 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3134  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.66 
 
 
319 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.999028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1001  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.99 
 
 
311 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06580  esterase/lipase  32.37 
 
 
316 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397736  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.92 
 
 
311 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00432  hypothetical protein  25.82 
 
 
319 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.97 
 
 
311 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.02 
 
 
337 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0519  acetyl esterase  25.66 
 
 
319 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.2 
 
 
309 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  34.76 
 
 
376 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1217  esterase/lipase/thioesterase  34.68 
 
 
312 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265662  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0567  acetyl esterase  24.75 
 
 
319 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.45 
 
 
310 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0407  acetyl esterase  25.66 
 
 
319 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.18 
 
 
352 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6392  hypothetical protein  36.05 
 
 
220 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.48 
 
 
309 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3675  esterase/lipase/thioesterase  29.81 
 
 
305 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0387  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.68 
 
 
306 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  34.38 
 
 
319 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0233  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.85 
 
 
293 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3151  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.99 
 
 
349 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  32.07 
 
 
309 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  32.23 
 
 
353 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0870  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.24 
 
 
310 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53129  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4767  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.45 
 
 
316 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4715  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.8 
 
 
296 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.14 
 
 
313 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  29.9 
 
 
321 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4571  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.86 
 
 
296 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3458  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.07 
 
 
306 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3484  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.65 
 
 
289 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1872  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.47 
 
 
321 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>