More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0448 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 292 aa  598  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  47.08 
 
 		 297 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  47.04 
 
 		 293 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  48.36 
 
 		 291 aa  258  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  43.96 
 
 		 283 aa  255  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  44.65 
 
 		 288 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  43.26 
 
 		 287 aa  252  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  44.17 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  43.66 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  43.28 
 
 		 288 aa  241  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  41.37 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  41.04 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  41.22 
 
 		 308 aa  208  8e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  38.3 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  37.54 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 		 284 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  34.6 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  40.09 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  35.29 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  33.08 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.21 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 307 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 		 288 aa  142  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  32.29 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  34.39 
 
 		 301 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.46 
 
 		 278 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  35.31 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  33.44 
 
 		 317 aa  135  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  31.94 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  30.93 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  33.8 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  29.62 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  31.79 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  31.79 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  31.79 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  31.79 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  29.78 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 		 349 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 		 272 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  34.39 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  30.71 
 
 		 296 aa  122  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6199  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82135  normal  0.298395 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 311 aa  118  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  26.88 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 		 308 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  29.04 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 349 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  30.23 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  55.45 
 
 		 350 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  34.56 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 274 aa  112  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>