More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0444 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  445  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  44.39 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3782  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.608196 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  26.73 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  29.14 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 238 aa  62  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  31.67 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1708  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000453712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.05 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  32.67 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  24.29 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  27.78 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>