More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0437 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 		 348 aa  682    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.71 
 
 		 363 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.55 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.55 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.07 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.53 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.21 
 
 		 357 aa  363  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.5 
 
 		 362 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.88 
 
 		 367 aa  360  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.26 
 
 		 358 aa  361  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.02 
 
 		 362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.97 
 
 		 358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.31 
 
 		 362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  61.05 
 
 		 356 aa  355  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.68 
 
 		 364 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.52 
 
 		 364 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.83 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.28 
 
 		 359 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.8 
 
 		 354 aa  346  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  56.81 
 
 		 374 aa  346  4e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.7 
 
 		 349 aa  345  8e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.18 
 
 		 364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.71 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.98 
 
 		 364 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.89 
 
 		 364 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.49 
 
 		 358 aa  335  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.12 
 
 		 364 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  52.08 
 
 		 384 aa  334  1e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.06 
 
 		 343 aa  328  9e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.91 
 
 		 356 aa  325  5e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  53.82 
 
 		 361 aa  322  4e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  59 
 
 		 359 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.87 
 
 		 355 aa  318  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.03 
 
 		 352 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.29 
 
 		 348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.14 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.1 
 
 		 355 aa  312  5.999999999999999e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.05 
 
 		 352 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.4 
 
 		 361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.87 
 
 		 354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.57 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  46.83 
 
 		 367 aa  296  5e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.64 
 
 		 350 aa  292  6e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0178  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.06 
 
 		 350 aa  288  7e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  48.07 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  46.93 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.71 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.71 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  46.47 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.53 
 
 		 349 aa  280  4e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  43.8 
 
 		 456 aa  279  5e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.09 
 
 		 352 aa  279  5e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.63 
 
 		 363 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  47.13 
 
 		 340 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.31 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  47.38 
 
 		 396 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.22 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  47.08 
 
 		 348 aa  275  6e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.28 
 
 		 348 aa  275  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  46.8 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.59 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.73 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.14 
 
 		 356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.14 
 
 		 356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.14 
 
 		 356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.99 
 
 		 357 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.73 
 
 		 339 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.73 
 
 		 339 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  42.25 
 
 		 377 aa  272  6e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.82 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  44.97 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  47.79 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  47.79 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.66 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 361 aa  270  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 365 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.73 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.41 
 
 		 345 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 339 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.84 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.88 
 
 		 340 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.83 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.23 
 
 		 344 aa  268  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.46 
 
 		 364 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.19 
 
 		 357 aa  268  7e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.26 
 
 		 353 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 339 aa  268  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.27 
 
 		 351 aa  268  8e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 		 339 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  45.81 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.36 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.65 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.83 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.65 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  45.43 
 
 		 346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.82 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.29 
 
 		 337 aa  266  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>