More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0403 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 313 aa  646    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  68.83 
 
 		 314 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  68.73 
 
 		 314 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  66.67 
 
 		 309 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  64.63 
 
 		 317 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  65.47 
 
 		 319 aa  417  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  65.48 
 
 		 308 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  65.36 
 
 		 328 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  65.48 
 
 		 310 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  64.22 
 
 		 316 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  65.57 
 
 		 316 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  65.69 
 
 		 309 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  64.71 
 
 		 312 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  64.05 
 
 		 312 aa  404  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  64.92 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  65.69 
 
 		 308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  64.92 
 
 		 316 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  64.05 
 
 		 312 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  64.17 
 
 		 304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  63.31 
 
 		 304 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  63.31 
 
 		 313 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  64.08 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  63.4 
 
 		 302 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  66.56 
 
 		 326 aa  391  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  60.66 
 
 		 303 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  60.53 
 
 		 308 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  60.86 
 
 		 308 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  61.69 
 
 		 305 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  59.41 
 
 		 308 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  59.54 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  60.86 
 
 		 308 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  59.54 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  59.54 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  62.18 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  55.7 
 
 		 310 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  60.06 
 
 		 331 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  57.7 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  57.65 
 
 		 311 aa  348  5e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  57.7 
 
 		 311 aa  345  4e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  54.75 
 
 		 307 aa  324  1e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  52.24 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  52.77 
 
 		 303 aa  315  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  52.13 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  52.79 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  58.15 
 
 		 306 aa  309  2.9999999999999997e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 309 aa  308  6.999999999999999e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  52.1 
 
 		 311 aa  308  8e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  52.1 
 
 		 311 aa  308  8e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  55.97 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 305 aa  306  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  51.31 
 
 		 307 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 303 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0077  ornithine carbamoyltransferase  46.62 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  51.48 
 
 		 355 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  50.52 
 
 		 305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 305 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  50.49 
 
 		 298 aa  300  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0046  ornithine carbamoyltransferase  46.1 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.425573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  56.98 
 
 		 312 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  52.43 
 
 		 312 aa  300  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  52.24 
 
 		 309 aa  298  7e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 304 aa  298  9e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 		 304 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 		 306 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 306 aa  295  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 		 301 aa  295  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 		 308 aa  295  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 		 300 aa  295  7e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 300 aa  295  9e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 303 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  47.8 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 		 309 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 		 309 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 		 309 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 		 309 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 		 309 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 		 309 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 		 309 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 		 309 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  53.9 
 
 		 315 aa  292  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 		 308 aa  291  9e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 302 aa  291  9e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 		 301 aa  291  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  48.06 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 305 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  47.9 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  47.48 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 		 306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 		 306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  51.38 
 
 		 303 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  48.01 
 
 		 305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 		 309 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>