More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0398 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
238 aa  482  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  58.22 
 
 
229 aa  272  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  55.04 
 
 
237 aa  265  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  53.78 
 
 
237 aa  260  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  53.78 
 
 
237 aa  260  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  54.7 
 
 
239 aa  258  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  55.13 
 
 
239 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  52.54 
 
 
238 aa  257  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  51.27 
 
 
238 aa  255  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  55.13 
 
 
240 aa  254  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  52.12 
 
 
239 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  50.85 
 
 
238 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  55.56 
 
 
243 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  50.21 
 
 
238 aa  248  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  51.69 
 
 
238 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  51.69 
 
 
238 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  50.85 
 
 
242 aa  247  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  56.19 
 
 
236 aa  242  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  56.19 
 
 
243 aa  242  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  54.47 
 
 
235 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  54.7 
 
 
240 aa  241  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  53.85 
 
 
240 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  53.85 
 
 
240 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  55.26 
 
 
242 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  52.81 
 
 
237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  47.68 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  48.93 
 
 
234 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  51.95 
 
 
237 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  52.4 
 
 
237 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  50.45 
 
 
231 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  50.88 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  51.09 
 
 
235 aa  217  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  49.57 
 
 
242 aa  214  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  49.78 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  49.78 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  47.41 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  49.58 
 
 
236 aa  211  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  49.14 
 
 
234 aa  208  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  47.91 
 
 
227 aa  206  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  47.39 
 
 
236 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  53.1 
 
 
232 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  47.83 
 
 
236 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  47.21 
 
 
240 aa  202  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  47.21 
 
 
240 aa  202  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  47.19 
 
 
256 aa  202  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  47.21 
 
 
240 aa  202  4e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  46.09 
 
 
237 aa  201  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  44.54 
 
 
236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  48.62 
 
 
228 aa  191  9e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  43.67 
 
 
233 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  43.67 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  44.1 
 
 
233 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  41.3 
 
 
231 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  45.02 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  42.65 
 
 
215 aa  171  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  42.45 
 
 
218 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  41.28 
 
 
233 aa  169  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  42.86 
 
 
237 aa  168  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  42.86 
 
 
237 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  40.27 
 
 
238 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  41.94 
 
 
234 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  41.94 
 
 
222 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  37.87 
 
 
232 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  40.27 
 
 
240 aa  166  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  40.27 
 
 
240 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  42.13 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  39.17 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  39.38 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  40.55 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  39.81 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  40.76 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  38.71 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.65 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  38.71 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  38.71 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  38.71 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  38.71 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  41.1 
 
 
236 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  40.83 
 
 
235 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  41.1 
 
 
236 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  41.1 
 
 
236 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  41.1 
 
 
236 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  41.2 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  39.81 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  39.62 
 
 
216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.67 
 
 
228 aa  162  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  39.17 
 
 
243 aa  162  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  41.96 
 
 
234 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  40.64 
 
 
236 aa  161  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  41.01 
 
 
234 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  40.83 
 
 
236 aa  161  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  42.01 
 
 
234 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  41.96 
 
 
234 aa  161  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  41.1 
 
 
236 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  40.28 
 
 
242 aa  161  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  40.09 
 
 
232 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  40.28 
 
 
242 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  40.93 
 
 
223 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  40.93 
 
 
223 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  39.81 
 
 
242 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.611464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>