More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0397 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0397  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
284 aa  590  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3118  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  78.4 
 
 
291 aa  417  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0430987  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0489  phosphate transporter ATP-binding protein  71.96 
 
 
271 aa  410  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0122  phosphate transporter ATP-binding protein  70.85 
 
 
271 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.341225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0181  phosphate transporter ATP-binding protein  70.85 
 
 
271 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4548  phosphate transporter ATP-binding protein  74.1 
 
 
302 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1536  phosphate transporter ATP-binding protein  72.09 
 
 
264 aa  401  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.424595  normal  0.394597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0601  phosphate transporter ATP-binding protein  75.81 
 
 
248 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1541  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  71.32 
 
 
265 aa  400  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871214  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0171  phosphate transporter ATP-binding protein  70.85 
 
 
271 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  73.49 
 
 
265 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0481  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  75.6 
 
 
263 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.180726  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  72.11 
 
 
265 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2601  phosphate transporter ATP-binding protein  72.11 
 
 
265 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0768  phosphate transporter ATP-binding protein  71.26 
 
 
273 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0255819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3752  phosphate transporter ATP-binding protein  65.53 
 
 
293 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4327  phosphate transporter ATP-binding protein  71.15 
 
 
265 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_004310  BR2141  phosphate transporter ATP-binding protein  72.8 
 
 
257 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  73.49 
 
 
275 aa  391  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1922  phosphate transporter ATP-binding protein  72.11 
 
 
265 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2056  phosphate transporter ATP-binding protein  72.4 
 
 
257 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12029  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2406  ABC phosphate transporter ATP-binding protein  70.12 
 
 
275 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3626  phosphate transporter ATP-binding protein  71.08 
 
 
295 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.926867  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1231  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.13 
 
 
281 aa  380  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.758755 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1225  phosphate transporter ATP-binding protein  70.92 
 
 
252 aa  381  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.315326  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1074  phosphate transporter ATP-binding protein  70.9 
 
 
247 aa  378  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.566041  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2292  phosphate transporter ATP-binding protein  64.39 
 
 
283 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.73 
 
 
254 aa  368  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0823  phosphate transporter ATP-binding protein  69.88 
 
 
260 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3315  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.74 
 
 
290 aa  368  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0283925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.33 
 
 
253 aa  357  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.24 
 
 
273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3540  response regulator receiver protein  62.26 
 
 
273 aa  348  8e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0379  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.86 
 
 
254 aa  345  7e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.198087  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0498  phosphate ABC transporter permease  62.65 
 
 
254 aa  343  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.15 
 
 
251 aa  343  2e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.02 
 
 
269 aa  341  9e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  60.08 
 
 
260 aa  340  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.35 
 
 
251 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  60.69 
 
 
261 aa  338  8e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0505  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  57.35 
 
 
276 aa  337  9e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.497855 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.31 
 
 
276 aa  338  9e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.96 
 
 
251 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.04 
 
 
252 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  63.86 
 
 
252 aa  336  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.25 
 
 
252 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  58.1 
 
 
281 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  61.22 
 
 
277 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.75 
 
 
253 aa  334  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  61.22 
 
 
277 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 
253 aa  333  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  63.6 
 
 
255 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.35 
 
 
251 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 
262 aa  332  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 
262 aa  332  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  60.31 
 
 
256 aa  332  5e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.36 
 
 
251 aa  332  5e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0354  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 
301 aa  332  6e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0142036  normal  0.246241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  57.19 
 
 
277 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  61 
 
 
277 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  62 
 
 
277 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  62 
 
 
277 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
272 aa  331  9e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  60.64 
 
 
249 aa  331  9e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  59.6 
 
 
253 aa  330  1e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2358  phosphate transporter ATP-binding protein  57.95 
 
 
273 aa  330  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 
272 aa  330  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0910  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.85 
 
 
305 aa  330  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  58.65 
 
 
277 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.23 
 
 
272 aa  330  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 
277 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2278  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.89 
 
 
253 aa  329  3e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  59.29 
 
 
272 aa  329  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 
272 aa  329  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 
272 aa  329  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.96 
 
 
252 aa  329  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 
272 aa  329  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1116  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.1 
 
 
249 aa  329  4e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.493823  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  61.07 
 
 
272 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  58.94 
 
 
285 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 
262 aa  328  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58 
 
 
251 aa  328  6e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
272 aa  328  6e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  62.4 
 
 
260 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
272 aa  328  6e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1919  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 
253 aa  328  6e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.603751  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
272 aa  328  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
272 aa  328  6e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  61.07 
 
 
272 aa  328  7e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01033  phosphate transporter ATP-binding protein  58.1 
 
 
272 aa  328  9e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2808  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.69 
 
 
265 aa  328  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  58.1 
 
 
272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  59.29 
 
 
272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1790  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 
297 aa  327  1.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530432  decreased coverage  0.00975681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.2 
 
 
273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1595  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.56 
 
 
301 aa  327  1.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3292  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.2 
 
 
273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2480  phosphate transporter ATP-binding protein  57.93 
 
 
268 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.85 
 
 
251 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>