21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0362 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0362  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  320  6e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2672  hypothetical protein  46.76 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1128  hypothetical protein  44.36 
 
 		 138 aa  110  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2403  hypothetical protein  38.6 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000119394  hitchhiker  0.00120616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2404  hypothetical protein  40.35 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000403861  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0120  hypothetical protein  35.4 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0585  hypothetical protein  36.27 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7652  hypothetical protein  35.9 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0166  hypothetical protein  34.82 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1186  hypothetical protein  31.09 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0036  hypothetical protein  37.25 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1432  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3898  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1573  hypothetical protein  31.97 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0760807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4779  hypothetical protein  34.23 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.52313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1324  hypothetical protein  34.23 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00524213  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1772  hypothetical protein  33.64 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4169  hypothetical protein  29.01 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5090  hypothetical protein  30.17 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0711061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2476  hypothetical protein  28.57 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00155227  normal  0.285117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>