More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0360 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  100 
 
 
553 aa  1133    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  49.54 
 
 
548 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  51.89 
 
 
551 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  54.69 
 
 
543 aa  542  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  50.18 
 
 
559 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  38.03 
 
 
539 aa  330  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  36.05 
 
 
470 aa  267  4e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  36.38 
 
 
472 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  35.2 
 
 
487 aa  265  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  36.05 
 
 
471 aa  264  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  35.82 
 
 
479 aa  260  4e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  35.31 
 
 
440 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  32.43 
 
 
500 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  33.97 
 
 
467 aa  239  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  33.9 
 
 
495 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  36.5 
 
 
466 aa  231  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  33.27 
 
 
517 aa  230  5e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  34.12 
 
 
491 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  33 
 
 
492 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  32.38 
 
 
510 aa  217  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  32.52 
 
 
457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  32.44 
 
 
465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  32.04 
 
 
452 aa  213  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  32.48 
 
 
453 aa  213  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  32.92 
 
 
489 aa  210  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  33.19 
 
 
484 aa  210  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  32.13 
 
 
490 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  33.07 
 
 
491 aa  207  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  31.12 
 
 
486 aa  205  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  32.84 
 
 
462 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  34.88 
 
 
458 aa  204  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  31.59 
 
 
482 aa  203  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  33.19 
 
 
462 aa  203  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  30.12 
 
 
482 aa  203  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  29.8 
 
 
470 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  31.65 
 
 
506 aa  200  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  30.92 
 
 
442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  31.2 
 
 
486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  30.88 
 
 
478 aa  196  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  32.24 
 
 
488 aa  196  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  32.38 
 
 
497 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  31.94 
 
 
631 aa  194  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  31.41 
 
 
438 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  29.85 
 
 
471 aa  190  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  30.71 
 
 
536 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  31.96 
 
 
500 aa  187  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  30.27 
 
 
501 aa  186  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  30.72 
 
 
453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  28.42 
 
 
558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  31.57 
 
 
470 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  30.64 
 
 
497 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  30.52 
 
 
520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  31.78 
 
 
481 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  30.66 
 
 
724 aa  183  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  29.24 
 
 
497 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  29.24 
 
 
497 aa  183  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  29.24 
 
 
497 aa  183  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  29.24 
 
 
497 aa  183  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  29.44 
 
 
453 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  31.08 
 
 
507 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  29.75 
 
 
497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  29.61 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  30.7 
 
 
543 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  28.91 
 
 
440 aa  180  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  29.92 
 
 
440 aa  179  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  29.44 
 
 
480 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  28.73 
 
 
533 aa  178  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  30.13 
 
 
637 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  29.47 
 
 
483 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  31.26 
 
 
474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  29.74 
 
 
442 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  28.63 
 
 
468 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  28.89 
 
 
457 aa  171  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  28.17 
 
 
582 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  28.63 
 
 
535 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  28.63 
 
 
535 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  28.63 
 
 
535 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  29.57 
 
 
523 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  28.96 
 
 
542 aa  167  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  29.26 
 
 
489 aa  166  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  28.46 
 
 
579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  28.52 
 
 
554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  30.37 
 
 
459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  29.26 
 
 
481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  30.22 
 
 
547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  29.2 
 
 
513 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  28.87 
 
 
519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  28.98 
 
 
584 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  26.24 
 
 
581 aa  163  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  29.5 
 
 
460 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  29.54 
 
 
526 aa  162  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  31.66 
 
 
496 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  29.49 
 
 
515 aa  161  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  27.78 
 
 
567 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  27.29 
 
 
522 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1755  sulfatase  28.97 
 
 
562 aa  161  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  29.9 
 
 
524 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  30.55 
 
 
522 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  29.53 
 
 
500 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  30.72 
 
 
544 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>