More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0356 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 114 aa  229  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  61.06 
 
 		 231 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  61.61 
 
 		 224 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 224 aa  140  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  61.61 
 
 		 230 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  61.61 
 
 		 224 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  61.61 
 
 		 224 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  61.61 
 
 		 224 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  61.61 
 
 		 224 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 233 aa  138  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  60.71 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 227 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  55.66 
 
 		 222 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  56.19 
 
 		 221 aa  122  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  55.24 
 
 		 221 aa  122  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 228 aa  122  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 222 aa  121  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  54.46 
 
 		 221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 221 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 223 aa  115  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  53.4 
 
 		 226 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  51.4 
 
 		 218 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 218 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  53.93 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  46.43 
 
 		 218 aa  107  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 235 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  43.69 
 
 		 184 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 235 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 235 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  47.12 
 
 		 221 aa  104  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 189 aa  104  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 218 aa  103  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  51.85 
 
 		 223 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 221 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 253 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  42.34 
 
 		 227 aa  99  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 219 aa  97.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 220 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 234 aa  95.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 226 aa  92.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 227 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  40.62 
 
 		 219 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  41.07 
 
 		 222 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  52.86 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  39 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  38 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36 
 
 		 550 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  37.62 
 
 		 247 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  37.14 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  31.46 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  31.46 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  40.22 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 		 480 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.18 
 
 		 548 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000142725  normal  0.651918 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  34.86 
 
 		 471 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.24 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  39.36 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  34.74 
 
 		 389 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  43.02 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  32.56 
 
 		 423 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  34.41 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  37.66 
 
 		 820 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  34.83 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  41.25 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  42.57 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2681  beta-lactamase-like  43.55 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  31.48 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.78 
 
 		 938 aa  55.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  36.11 
 
 		 565 aa  56.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  37.23 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2508  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  47.83 
 
 		 363 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  33.98 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.19 
 
 		 566 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.19 
 
 		 566 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3004  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40 
 
 		 560 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  33.93 
 
 		 380 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  38.64 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.29 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  36.14 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  33.72 
 
 		 470 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>