214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0307 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  59.23 
 
 		 606 aa  739    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  61.73 
 
 		 624 aa  759    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  52.34 
 
 		 594 aa  635    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  61.09 
 
 		 618 aa  739    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  56.59 
 
 		 596 aa  699    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  57.81 
 
 		 599 aa  718    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  60.07 
 
 		 620 aa  741    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  61.69 
 
 		 593 aa  765    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  55.72 
 
 		 589 aa  686    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  54.85 
 
 		 598 aa  672    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  54.35 
 
 		 593 aa  639    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  59.14 
 
 		 657 aa  734    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  60.4 
 
 		 606 aa  741    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  59.4 
 
 		 606 aa  740    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  54.24 
 
 		 595 aa  649    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  61.46 
 
 		 598 aa  744    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  59.47 
 
 		 640 aa  727    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  54.85 
 
 		 598 aa  672    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  56.48 
 
 		 598 aa  691    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 603 aa  1244    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  52.17 
 
 		 595 aa  634  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  51.09 
 
 		 592 aa  627  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  49.33 
 
 		 597 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  49.17 
 
 		 597 aa  569  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  37.77 
 
 		 593 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  37.44 
 
 		 593 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  36.95 
 
 		 594 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  35.05 
 
 		 605 aa  318  3e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  34.21 
 
 		 613 aa  316  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  34.25 
 
 		 608 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  34.85 
 
 		 609 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  35.63 
 
 		 586 aa  311  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  34.69 
 
 		 609 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  34.69 
 
 		 609 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  34.46 
 
 		 610 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  34.46 
 
 		 610 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  34.46 
 
 		 610 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  34.46 
 
 		 610 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  34.46 
 
 		 610 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  34.46 
 
 		 610 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  34.46 
 
 		 610 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  36.33 
 
 		 596 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  34.69 
 
 		 609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  34.75 
 
 		 609 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  35.53 
 
 		 602 aa  307  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  34.64 
 
 		 609 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  35.16 
 
 		 613 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  35.69 
 
 		 602 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  34.53 
 
 		 611 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  33.65 
 
 		 623 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  33.66 
 
 		 619 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  33.66 
 
 		 619 aa  302  9e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  34.42 
 
 		 626 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  34.72 
 
 		 605 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  33.5 
 
 		 627 aa  301  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  33.81 
 
 		 623 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  33.61 
 
 		 602 aa  300  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  34.46 
 
 		 598 aa  300  7e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  34.3 
 
 		 605 aa  299  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  34.29 
 
 		 619 aa  299  9e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  34.98 
 
 		 600 aa  299  9e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  33.66 
 
 		 665 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  34.15 
 
 		 597 aa  297  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  33.59 
 
 		 628 aa  296  6e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  33.81 
 
 		 620 aa  296  6e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  33.44 
 
 		 600 aa  296  7e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  33.44 
 
 		 629 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  34.89 
 
 		 617 aa  296  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 619 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  34.15 
 
 		 598 aa  294  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  33.76 
 
 		 626 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  32.37 
 
 		 612 aa  293  7e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  34.55 
 
 		 599 aa  293  9e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  33.93 
 
 		 599 aa  291  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  33.66 
 
 		 595 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  35.34 
 
 		 627 aa  290  8e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  34.27 
 
 		 611 aa  289  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  32.96 
 
 		 594 aa  289  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  34.3 
 
 		 601 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  32.79 
 
 		 611 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  33.28 
 
 		 629 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  32.84 
 
 		 602 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  33.17 
 
 		 593 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  33.93 
 
 		 850 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  33.44 
 
 		 614 aa  283  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 594 aa  283  7.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  34.6 
 
 		 601 aa  283  9e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  31.22 
 
 		 610 aa  282  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  32.23 
 
 		 599 aa  282  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  33.23 
 
 		 613 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  33.66 
 
 		 602 aa  282  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  32.28 
 
 		 636 aa  280  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  33.01 
 
 		 612 aa  280  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  33.5 
 
 		 594 aa  279  9e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  34.1 
 
 		 610 aa  279  9e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  31.24 
 
 		 625 aa  278  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  30.62 
 
 		 606 aa  277  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  31.37 
 
 		 596 aa  276  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2093  glycoside hydrolase 15-related  34.68 
 
 		 727 aa  275  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708631 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  33.06 
 
 		 596 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>