233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0303 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
246 aa  467  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  47.84 
 
 
714 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  47.93 
 
 
714 aa  215  5e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  46.31 
 
 
244 aa  194  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  49.51 
 
 
245 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  51.28 
 
 
266 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  46.88 
 
 
242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  44.26 
 
 
245 aa  164  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  50 
 
 
243 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  45.09 
 
 
238 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  44.12 
 
 
252 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  44.33 
 
 
265 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  50.72 
 
 
219 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  38.5 
 
 
224 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  41.41 
 
 
224 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  40.53 
 
 
224 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  41.59 
 
 
228 aa  148  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  45.83 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  38.16 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  45.83 
 
 
282 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  39.83 
 
 
226 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  47.87 
 
 
251 aa  145  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.01 
 
 
746 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.73 
 
 
713 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  43.59 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  42.23 
 
 
722 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  37.74 
 
 
229 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  34.89 
 
 
229 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  37.23 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.68 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  46.71 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  35.78 
 
 
717 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  37.98 
 
 
716 aa  118  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  36.53 
 
 
231 aa  116  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  37.67 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
716 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  34.74 
 
 
738 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  33.04 
 
 
704 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.6 
 
 
717 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36 
 
 
717 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  36.12 
 
 
236 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  34.93 
 
 
227 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  34.4 
 
 
225 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  35.68 
 
 
623 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.8 
 
 
722 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  36 
 
 
232 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.33 
 
 
722 aa  102  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  35.02 
 
 
238 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.02 
 
 
712 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  33.92 
 
 
713 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  39.56 
 
 
229 aa  97.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.59 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6067  SNARE associated Golgi protein  40.84 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  32.88 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0460  hypothetical protein  33.77 
 
 
258 aa  92.8  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.955509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  40.65 
 
 
320 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  41.48 
 
 
325 aa  89.4  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  30.67 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  30.67 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  40.46 
 
 
222 aa  87  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.1 
 
 
705 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  34.67 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  34 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  38.41 
 
 
720 aa  82.8  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
227 aa  82  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  37.23 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  32.72 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  36.5 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  32.14 
 
 
242 aa  78.6  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  34.53 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  33.96 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  35 
 
 
207 aa  77  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  32.84 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  33.7 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.46 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  37.12 
 
 
149 aa  74.7  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  29.63 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.2 
 
 
238 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  35.07 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  35.77 
 
 
724 aa  73.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  35.34 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  31.51 
 
 
735 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  32.34 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  36.3 
 
 
239 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  41.07 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  29.59 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.04 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  36.71 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  24.35 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  30.49 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  36.76 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  30.6 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  29.48 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  30.2 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  29.48 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  29.48 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  33.04 
 
 
174 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  30.87 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  29.48 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  29.48 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>