More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0290 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
456 aa  921    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  52.61 
 
 
459 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  46.59 
 
 
461 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  50.36 
 
 
469 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  49.65 
 
 
463 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  46.39 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  46.39 
 
 
464 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  46.56 
 
 
513 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  46.45 
 
 
514 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  46.6 
 
 
476 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  46.82 
 
 
461 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  49.15 
 
 
459 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  46.37 
 
 
489 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  47.44 
 
 
454 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  47.36 
 
 
457 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  48.06 
 
 
459 aa  382  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  47.13 
 
 
469 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  46.68 
 
 
460 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  46.45 
 
 
460 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  47.12 
 
 
448 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  46.45 
 
 
460 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  45.93 
 
 
448 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  45.93 
 
 
448 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  45.1 
 
 
468 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  45.63 
 
 
472 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  43.93 
 
 
477 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  43.1 
 
 
453 aa  344  2e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  44.08 
 
 
463 aa  338  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  41.19 
 
 
467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  39.57 
 
 
453 aa  297  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  38.24 
 
 
453 aa  296  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  42.23 
 
 
453 aa  295  8e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  39.95 
 
 
470 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  39.05 
 
 
452 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  42.27 
 
 
466 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  38.16 
 
 
453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  39.95 
 
 
492 aa  274  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  39.59 
 
 
499 aa  273  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  36.59 
 
 
465 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  37.73 
 
 
494 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  38.52 
 
 
459 aa  269  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  38.55 
 
 
470 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  37.95 
 
 
477 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  37.83 
 
 
501 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  36.43 
 
 
465 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  36.43 
 
 
465 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  35.31 
 
 
454 aa  263  4.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  34.7 
 
 
441 aa  259  6e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  34.7 
 
 
441 aa  259  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  38 
 
 
448 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  36.73 
 
 
484 aa  257  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  32.58 
 
 
459 aa  257  3e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  34.16 
 
 
442 aa  257  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  34.79 
 
 
455 aa  256  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  39.44 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  37.05 
 
 
451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  35.51 
 
 
506 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  36.1 
 
 
459 aa  254  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  36.47 
 
 
450 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  35.02 
 
 
504 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  35.91 
 
 
493 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  35.16 
 
 
493 aa  252  9.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  36.02 
 
 
451 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  35.29 
 
 
530 aa  252  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  36.34 
 
 
451 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  35.87 
 
 
451 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  36 
 
 
450 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  36.1 
 
 
451 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  39.49 
 
 
509 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  37.88 
 
 
484 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  37.88 
 
 
484 aa  246  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  35.28 
 
 
455 aa  243  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0849  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  35.82 
 
 
438 aa  242  9e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.745956  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  33.33 
 
 
489 aa  241  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  38.98 
 
 
443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1057  M16 family peptidase  34.7 
 
 
439 aa  238  1e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  36.43 
 
 
479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  36.99 
 
 
481 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  34.63 
 
 
460 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  39.64 
 
 
473 aa  230  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0761  insulinase family protease  31.69 
 
 
446 aa  228  2e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.126087  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  32.86 
 
 
441 aa  224  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  31.06 
 
 
461 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  32.08 
 
 
447 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  31.6 
 
 
443 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  30.88 
 
 
442 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  31.95 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  30.94 
 
 
440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  30.75 
 
 
443 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  31.12 
 
 
443 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  30.88 
 
 
443 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  30.38 
 
 
422 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  36.72 
 
 
424 aa  210  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  30.64 
 
 
443 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  31.43 
 
 
443 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  30.64 
 
 
443 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  31.89 
 
 
440 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  30.64 
 
 
443 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  33.02 
 
 
937 aa  207  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  34.8 
 
 
422 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>