254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0218 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  100 
 
 		 66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  68.75 
 
 		 403 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  71.88 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  68.75 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  71.88 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  68.75 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  71.88 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  67.19 
 
 		 67 aa  90.9  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  69.7 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  70.31 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  65.15 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  70.31 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4533  50S ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4268  50S ribosomal protein L35  65.62 
 
 		 67 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0128  50S ribosomal protein L35P  68.75 
 
 		 66 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0134182  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3484  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1315  50S ribosomal protein L35  62.5 
 
 		 67 aa  84.7  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  64.06 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0068  50S ribosomal protein L35  65.15 
 
 		 66 aa  84  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.5109  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0673  50S ribosomal protein L35P  60.61 
 
 		 66 aa  84  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  63.08 
 
 		 66 aa  84.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  63.08 
 
 		 66 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  63.08 
 
 		 66 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  63.08 
 
 		 66 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  66.15 
 
 		 67 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0685  50S ribosomal protein L35  66.15 
 
 		 67 aa  83.6  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513198  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  64.62 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  65.15 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  59.09 
 
 		 66 aa  81.6  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  59.09 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  63.64 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  63.64 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  61.54 
 
 		 67 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  56.92 
 
 		 66 aa  80.1  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  62.12 
 
 		 66 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  62.12 
 
 		 66 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  63.64 
 
 		 66 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0864  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 68 aa  77.4  0.00000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1192  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  53.85 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2922  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  53.03 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  52.31 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  51.52 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  53.12 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  46.55 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  50 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1881  50S ribosomal protein L35  53.73 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0627786 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  51.85 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  40.91 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1974  50S ribosomal protein L35  52.24 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  45.16 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  42.42 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  45.45 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  43.1 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  49.12 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  46.15 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 		 65 aa  50.8  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>