208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0204 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 264 aa  532  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  59.01 
 
 		 290 aa  261  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  52.42 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  50.19 
 
 		 257 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  55.02 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  54.51 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  54.67 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  50.96 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  54.59 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  54.47 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  50.88 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  49.14 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  47.28 
 
 		 272 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  50 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  51.94 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  48.09 
 
 		 259 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  51.56 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  50.44 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  49.56 
 
 		 263 aa  215  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  45.6 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  48.18 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  48.9 
 
 		 647 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  47.97 
 
 		 271 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  48.89 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  46.75 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  43.23 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  48.89 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  44.73 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  49.33 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  49.78 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  42.46 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  45.33 
 
 		 247 aa  192  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  45.09 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  43.15 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  40.18 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  46.52 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  49.78 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  45.27 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  43.59 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  36.52 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  38.21 
 
 		 257 aa  161  8.000000000000001e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  36.16 
 
 		 279 aa  148  8e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  35.35 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  35.35 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  30.93 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  27.06 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  26.23 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  31.18 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  30.57 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  33 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05110  expressed protein  36.89 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  29.72 
 
 		 409 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  28.57 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  30.21 
 
 		 406 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  27.7 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.47 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  26.47 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  43.16 
 
 		 402 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  28.96 
 
 		 410 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  27.32 
 
 		 359 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  27.32 
 
 		 336 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  29.84 
 
 		 406 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  34.97 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  26.37 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1559  alpha/beta hydrolase fold protein  35.54 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0478161  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  26.19 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  37.19 
 
 		 412 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.57 
 
 		 369 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  43.06 
 
 		 396 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  38.36 
 
 		 405 aa  50.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  28.5 
 
 		 407 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  41.33 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  28.02 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  29.84 
 
 		 405 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  26.89 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  27.98 
 
 		 406 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.71 
 
 		 374 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  29.23 
 
 		 413 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  28.3 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  24.87 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  31.34 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  25.31 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  30.17 
 
 		 407 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  40.79 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0406  homoserine O-acetyltransferase  43.08 
 
 		 380 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  25.81 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  27.57 
 
 		 423 aa  46.6  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  30.26 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 350 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0132  protein of unknown function UPF0227  27.96 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.440551  hitchhiker  0.0000000954344 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 		 352 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  24.06 
 
 		 284 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1379  protein of unknown function UPF0227  26.86 
 
 		 214 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.510697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>