More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0193 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  100 
 
 
267 aa  534  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  75.63 
 
 
263 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  69.85 
 
 
336 aa  357  2e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  74.59 
 
 
332 aa  355  3e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  72.73 
 
 
333 aa  355  5e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  73.95 
 
 
264 aa  354  9e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  74.26 
 
 
317 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  74.68 
 
 
317 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  73.53 
 
 
288 aa  350  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  73.84 
 
 
316 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  73.84 
 
 
314 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  73.28 
 
 
310 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  67.66 
 
 
282 aa  343  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  67.87 
 
 
277 aa  340  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  67.87 
 
 
254 aa  340  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  70.69 
 
 
279 aa  337  9e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  68.75 
 
 
253 aa  336  2e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  68.46 
 
 
290 aa  335  4e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  67.55 
 
 
289 aa  334  9e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  71.98 
 
 
270 aa  332  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  72.08 
 
 
289 aa  332  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  69.44 
 
 
282 aa  331  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  67.07 
 
 
254 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  65.4 
 
 
256 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  69.55 
 
 
321 aa  330  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  70.89 
 
 
311 aa  329  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  71.98 
 
 
261 aa  328  5e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  71.31 
 
 
283 aa  328  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  68.53 
 
 
268 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  62.92 
 
 
249 aa  323  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  62.45 
 
 
252 aa  323  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  66.81 
 
 
264 aa  321  8e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  68.97 
 
 
258 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  68.97 
 
 
258 aa  319  4e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  63.45 
 
 
253 aa  316  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  66.12 
 
 
271 aa  315  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  63.35 
 
 
258 aa  316  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  65.13 
 
 
253 aa  315  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  65.13 
 
 
253 aa  315  6e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  65.55 
 
 
267 aa  312  4e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  61.73 
 
 
244 aa  306  2e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  60.5 
 
 
241 aa  295  4e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  60.5 
 
 
241 aa  295  4e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  61.51 
 
 
264 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.5 
 
 
241 aa  289  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  60.32 
 
 
265 aa  288  9e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  58.4 
 
 
241 aa  287  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  61.11 
 
 
268 aa  287  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  62.6 
 
 
268 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  58.4 
 
 
241 aa  287  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  57.98 
 
 
241 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  57.72 
 
 
246 aa  286  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.4361e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  59.66 
 
 
241 aa  286  3e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  59.24 
 
 
241 aa  285  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 
246 aa  285  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  61.76 
 
 
263 aa  284  8e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  59.04 
 
 
263 aa  284  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  59.27 
 
 
255 aa  284  1e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  59.24 
 
 
241 aa  284  1e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  58.7 
 
 
258 aa  284  1e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  56.67 
 
 
244 aa  284  1e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  55.27 
 
 
246 aa  284  1e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  56.25 
 
 
244 aa  284  1e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  59.67 
 
 
258 aa  283  2e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  57.98 
 
 
243 aa  283  2e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  58.61 
 
 
258 aa  283  2e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  59.09 
 
 
262 aa  283  3e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  59.09 
 
 
262 aa  283  3e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  58.82 
 
 
241 aa  282  3e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  57.38 
 
 
244 aa  282  3e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  59.09 
 
 
255 aa  282  4e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  59.26 
 
 
258 aa  282  4e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.98 
 
 
241 aa  282  4e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  59.26 
 
 
258 aa  282  4e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  58.13 
 
 
261 aa  282  4e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  59.26 
 
 
258 aa  282  4e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  57.98 
 
 
241 aa  281  6e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  58.13 
 
 
261 aa  281  6e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 
262 aa  281  7e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  60.91 
 
 
268 aa  281  7e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  59.26 
 
 
258 aa  281  8e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  58.65 
 
 
247 aa  281  9e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  58.2 
 
 
258 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  58.2 
 
 
258 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  58.4 
 
 
241 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  58.2 
 
 
258 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  58.2 
 
 
258 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  58.2 
 
 
258 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  58.2 
 
 
258 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  58.82 
 
 
241 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  57.89 
 
 
266 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  56.96 
 
 
241 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  58.2 
 
 
258 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  58.4 
 
 
241 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  55.26 
 
 
264 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  58.85 
 
 
258 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  55.88 
 
 
241 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 
241 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  57.03 
 
 
256 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  57.56 
 
 
241 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>