More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0180 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  512  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  46.59 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  45.42 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  42.23 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  42.23 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  45.12 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  41.47 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  44.35 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  41.22 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  36.92 
 
 		 259 aa  188  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  43.55 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  44.35 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  44.86 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  44.36 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  46.15 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  45.8 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  42.74 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  43.95 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  42.34 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  40.48 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  43.72 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  40.59 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  41.33 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  41.34 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  40.66 
 
 		 276 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  43.51 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0733  ABC transporter related  34.54 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  45.78 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  39.42 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  39.42 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  39.42 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  39.83 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  42.57 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  39.02 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  41.7 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  38.55 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  38.55 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  36.65 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  38.55 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  38.22 
 
 		 269 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  34.54 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  43.9 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  40.17 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  42.4 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  42.51 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  41.83 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  42.98 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1830  hemin importer ATP-binding subunit  41.33 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  38.96 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1775  hemin importer ATP-binding subunit  41.33 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  41.53 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0830  hemin importer ATP-binding subunit  41.33 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1121  hemin importer ATP-binding subunit  41.33 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.402824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0341  hemin importer ATP-binding subunit  41.33 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853045  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2096  hemin importer ATP-binding subunit  41.33 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0434  hemin importer ATP-binding subunit  41.33 
 
 		 272 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  42.98 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  45.19 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  42.55 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  42.55 
 
 		 290 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  42.55 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  37.39 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  43.5 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0077  ABC transporter related protein  41.86 
 
 		 272 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  33.73 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  40.23 
 
 		 424 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  40.98 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  39.76 
 
 		 254 aa  165  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  36.4 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  41.25 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  38.49 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  42.41 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  37.75 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  41.8 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  38.8 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01538  ABC-type hemin transport system, ATPase component  36.11 
 
 		 276 aa  162  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.554253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 		 270 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  39.36 
 
 		 272 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  38.11 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  36.99 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  40.17 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  39.02 
 
 		 490 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.13 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.59 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.13 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  37.75 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  39.43 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1543  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  31.13 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  37.5 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 292 aa  159  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  41.37 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>