118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0156 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0156  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3813  hypothetical protein  56.08 
 
 
148 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0202371  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5769  hypothetical protein  60.27 
 
 
147 aa  181  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4070  hypothetical protein  59.18 
 
 
147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0663  hypothetical protein  53.42 
 
 
146 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595218  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4077  hypothetical protein  56.08 
 
 
148 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3723  hypothetical protein  55.41 
 
 
148 aa  167  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4756  hypothetical protein  54.11 
 
 
147 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2726  hypothetical protein  54.42 
 
 
146 aa  164  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2528  hypothetical protein  51.68 
 
 
149 aa  158  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.691181  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4168  hypothetical protein  51.7 
 
 
146 aa  153  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3987  hypothetical protein  50.34 
 
 
152 aa  152  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5026  hypothetical protein  51.02 
 
 
146 aa  148  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000215714  normal  0.277815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2939  hypothetical protein  47.26 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1609  hypothetical protein  48.99 
 
 
148 aa  137  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1540  hypothetical protein  44.9 
 
 
150 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.911889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1563  hypothetical protein  44.9 
 
 
150 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1511  hypothetical protein  44.22 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.538962  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4038  MaoC-like dehydratase  40.82 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4154  MaoC domain protein dehydratase  40.14 
 
 
144 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.540186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4181  MaoC domain protein dehydratase  40.14 
 
 
144 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155418  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0448  hypothetical protein  38.26 
 
 
170 aa  106  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423979  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5102  hypothetical protein  38.1 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.841887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03550  acyl dehydratase  36.55 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413413  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0390  MaoC-like dehydratase  38.26 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2666  hypothetical protein  35.86 
 
 
152 aa  87.4  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.509352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  37.24 
 
 
145 aa  86.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3941  hypothetical protein  36.3 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4333  hypothetical protein  35.62 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  38.52 
 
 
335 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3212  MaoC-like dehydratase  39.55 
 
 
152 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.388942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3274  dehydratase  39.55 
 
 
152 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3223  dehydratase  39.55 
 
 
152 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  33.11 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6647  hypothetical protein  33.79 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6066  hypothetical protein  33.77 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.421262  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1009  hypothetical protein  36.99 
 
 
149 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4530  hypothetical protein  30.82 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.877257  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0564  hypothetical protein  32.45 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6627  hypothetical protein  33.78 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal  0.949835 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  34.03 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0160  MaoC domain protein dehydratase  30.28 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.424795  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21400  acyl dehydratase  31.03 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0000186279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0898  hypothetical protein  37.17 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.246332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2693  MaoC domain protein dehydratase  28.97 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0357  MaoC domain-containing protein dehydratase  31.97 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0288  hypothetical protein  37.11 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17520  hypothetical protein  31.62 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414084  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2678  hypothetical protein  28.05 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0349464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3183  MaoC domain protein dehydratase  29.46 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0253382 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21190  acyl dehydratase  34.09 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07680  hypothetical protein  30.25 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0469422 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1778  hypothetical protein  28.68 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1060  hypothetical protein  32.23 
 
 
158 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353069  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3027  hypothetical protein  34.26 
 
 
157 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0673  MaoC-like dehydratase  33.67 
 
 
177 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0686  dehydratase  33.67 
 
 
177 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.169172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0666  dehydratase  33.67 
 
 
177 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2739  hypothetical protein  32.39 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705553 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0562  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0892456  normal  0.0661028 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2496  hypothetical protein  27.86 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0599  MaoC-like dehydratase  31.06 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4039  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.798553 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2780  hypothetical protein  32.52 
 
 
158 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.189937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2873  hypothetical protein  32.52 
 
 
162 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2687  hypothetical protein  32.91 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4084  hypothetical protein  26.67 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0070  MaoC-like dehydratase  29.52 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112282  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0664  hypothetical protein  30.63 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00923819  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0738  MaoC domain protein dehydratase  29.23 
 
 
188 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  33.9 
 
 
288 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10515  hypothetical protein  30.23 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0842  MaoC-like dehydratase  28.32 
 
 
180 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.659825  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2840  MaoC domain protein dehydratase  33.03 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  32.35 
 
 
311 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  30.51 
 
 
333 aa  52  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10650  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  30.3 
 
 
166 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0506433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  36.62 
 
 
285 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  28.68 
 
 
319 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  31.78 
 
 
324 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  30.37 
 
 
318 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  30.37 
 
 
318 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3995  hypothetical protein  29.66 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.268116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0920  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0670  hypothetical protein  25.34 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0367273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  28.38 
 
 
282 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0937  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4069  hypothetical protein  28.46 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0948  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadC  31 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  29.63 
 
 
317 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  31.78 
 
 
317 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  25.36 
 
 
343 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  32.03 
 
 
312 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  43.18 
 
 
287 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6365  hypothetical protein  35.05 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937275  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0907  dehydratase  30 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1106  MaoC domain protein dehydratase  24.24 
 
 
352 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  24.64 
 
 
343 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  33.78 
 
 
276 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1430  dehydratase  24.62 
 
 
349 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>