More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0150 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  100 
 
 
217 aa  424  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  60.19 
 
 
212 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  58.25 
 
 
212 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  57.69 
 
 
216 aa  224  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  57.75 
 
 
219 aa  219  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  56.8 
 
 
212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  57.28 
 
 
219 aa  216  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  59.22 
 
 
212 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  60 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  55.29 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  57.62 
 
 
214 aa  210  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  54.72 
 
 
215 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  55.83 
 
 
212 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  58.25 
 
 
209 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  57 
 
 
211 aa  209  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  61.17 
 
 
208 aa  208  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  57.28 
 
 
212 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  52.83 
 
 
212 aa  207  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  53.08 
 
 
217 aa  203  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  53.33 
 
 
218 aa  203  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  58.1 
 
 
194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  51.94 
 
 
215 aa  198  5e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  52.15 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  57.35 
 
 
211 aa  194  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  55.34 
 
 
208 aa  193  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  56.13 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  53.2 
 
 
212 aa  188  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  58.55 
 
 
208 aa  188  7e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  56.4 
 
 
211 aa  187  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  57.56 
 
 
206 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  57.62 
 
 
222 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  57.62 
 
 
222 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  55.61 
 
 
217 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  57.97 
 
 
212 aa  179  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  52.2 
 
 
203 aa  178  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  50.95 
 
 
208 aa  174  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  58.85 
 
 
210 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  50 
 
 
212 aa  171  9e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  50.24 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  43.78 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  43.78 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  45.19 
 
 
221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  40.27 
 
 
237 aa  160  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  38.94 
 
 
230 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  38.94 
 
 
230 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  42.06 
 
 
227 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0641  cytidylate kinase  42.92 
 
 
237 aa  157  8e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272482  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1536  cytidylate kinase  42.92 
 
 
237 aa  157  8e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000588366  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  43.52 
 
 
229 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  43.26 
 
 
229 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  41.59 
 
 
232 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  46.41 
 
 
219 aa  153  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  42.52 
 
 
228 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  38.43 
 
 
225 aa  151  8.999999999999999e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  37.55 
 
 
231 aa  150  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  42.06 
 
 
228 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  41.59 
 
 
228 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  41.59 
 
 
225 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  43.93 
 
 
229 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  39.38 
 
 
231 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  42.99 
 
 
229 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  43 
 
 
225 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  43.46 
 
 
229 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  36.73 
 
 
230 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  43.84 
 
 
227 aa  148  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  43.66 
 
 
225 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  41.18 
 
 
226 aa  147  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.1 
 
 
511 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  37.72 
 
 
226 aa  147  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.1 
 
 
511 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1674  cytidylate kinase  40.91 
 
 
251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  39.47 
 
 
227 aa  146  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  40.58 
 
 
227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1197  cytidylate kinase  41.86 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  41.04 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  37.33 
 
 
214 aa  145  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  37.22 
 
 
226 aa  145  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  39.25 
 
 
227 aa  145  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  38.64 
 
 
221 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  39.04 
 
 
227 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  39.04 
 
 
227 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  39.04 
 
 
227 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  39.04 
 
 
227 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  39.04 
 
 
227 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  39.04 
 
 
227 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  37.61 
 
 
230 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  39.04 
 
 
227 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  37.61 
 
 
230 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  37.61 
 
 
230 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  38.67 
 
 
229 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  38.5 
 
 
230 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  39.04 
 
 
227 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  39.04 
 
 
227 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  37.61 
 
 
230 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  39.04 
 
 
227 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  39.04 
 
 
227 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  41.98 
 
 
224 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  39.04 
 
 
227 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  39.04 
 
 
227 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  38.05 
 
 
230 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>