12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0100 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0100  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  759    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243385 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0084  hypothetical protein  27.98 
 
 		 383 aa  105  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1041  hypothetical protein  24.55 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2650  replication initiation factor  27.81 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2276  replication initiation factor  34.38 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00843988  hitchhiker  0.00603168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1039  hypothetical protein  26.67 
 
 		 468 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3067  replication initiation factor  26.88 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0900674  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1477  hypothetical protein  26.07 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.192207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3699  hypothetical protein  27.24 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3581  hypothetical protein  25.86 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106267  normal  0.283892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0392  hypothetical protein  29.5 
 
 		 382 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.375122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2011  hypothetical protein  31.2 
 
 		 431 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>