More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0080 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0080  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0577  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  40.08 
 
 		 245 aa  172  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  41.38 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  39.66 
 
 		 245 aa  168  9e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.08 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  40.95 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  39.83 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2983  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 242 aa  166  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000906081  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 253 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  39.41 
 
 		 244 aa  165  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 238 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  37.45 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  37.76 
 
 		 244 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3730  winged helix family two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 238 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  39.22 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  36.86 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.23 
 
 		 239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0200  two component transcriptional regulator  36.55 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.86 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.08 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  38.08 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003939  TorCAD operon transcriptional regulatory protein TorR  35.78 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0753413  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0531  DNA-binding response regulator  39.58 
 
 		 245 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2121  DNA-binding response regulator  39.58 
 
 		 245 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0885999  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2023  DNA-binding response regulator  39.58 
 
 		 245 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485022  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 240 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 230 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  36.95 
 
 		 251 aa  161  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  39.33 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  35.22 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  37.86 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0746  DNA-binding response regulator  39.58 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0713  DNA-binding response regulator  39.58 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0602  DNA-binding response regulator  39.58 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1669  DNA-binding response regulator  39.58 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.501573  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01583  DNA-binding transcriptional regulator TorR  36.97 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  39.57 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65880  putative two-component response regulator  39.09 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0780512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  38.2 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1574  osmolarity response regulator  39.82 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.71 
 
 		 246 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 244 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.51 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  38.7 
 
 		 232 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  38.7 
 
 		 232 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5717  putative two-component response regulator  39 
 
 		 245 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  36.96 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  37.71 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  37.6 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.71 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  37.71 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  41.6 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3280  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  37.24 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2473  DNA-binding response regulator  36.29 
 
 		 242 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  37.71 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  37.71 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.93 
 
 		 259 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.55 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  37.71 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  37.71 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  37.71 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  37.71 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  37.71 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  37.6 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  37.71 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  37.71 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  37.71 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  37.71 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  37.71 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  37.71 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.08 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>