41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0078 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  100 
 
 
140 aa  274  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2536  TadE-like protein  30.23 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  38.82 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  49.06 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  50 
 
 
164 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  49.06 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  49.06 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  49.06 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  49.06 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  49.06 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  49.06 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  50 
 
 
164 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  50 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  50 
 
 
164 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  41.67 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  32.29 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  34.52 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  31.43 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  38.1 
 
 
163 aa  48.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  44 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  31.11 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  37.68 
 
 
156 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  43.86 
 
 
181 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  45.83 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1342  TadE-like  34.74 
 
 
175 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392152  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  45.83 
 
 
165 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  43.14 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  33.78 
 
 
167 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  43.14 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  25.2 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3156  TadE-like  29.23 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3505  TadE family protein  41.18 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124271  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  38.46 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  36 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  36.84 
 
 
134 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  28.97 
 
 
174 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  29.77 
 
 
185 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2273  TadE-like protein  32.06 
 
 
193 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  23.62 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3251  TadE family protein  29.46 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  38.46 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>