109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0075 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 295 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 280 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 280 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  35.03 
 
 		 275 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  35.8 
 
 		 275 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 275 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.51 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  35.59 
 
 		 275 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  34.25 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.56 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  29.56 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  33.33 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  32.97 
 
 		 295 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  32.78 
 
 		 311 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  32.78 
 
 		 311 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  32.78 
 
 		 311 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  32.78 
 
 		 311 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  32.78 
 
 		 311 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  32.78 
 
 		 311 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  32.22 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  37.43 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  31.06 
 
 		 311 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  32.12 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.08 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  31.67 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  28.69 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 1737 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 566 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 573 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  35.23 
 
 		 1600 aa  48.9  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  28.14 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.04 
 
 		 610 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  28.91 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1897  TPR repeat-containing protein  37.98 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935119 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 762 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  34.02 
 
 		 897 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 1421 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 1486 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  27.27 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.3 
 
 		 708 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  27.42 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 589 aa  46.2  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0299  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 306 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 732 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1712  peptidase M48, Ste24p  33.58 
 
 		 491 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189246  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  29.5 
 
 		 336 aa  45.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1518  TPR domain-containing protein  26.28 
 
 		 258 aa  45.4  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  27.46 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0551  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 188 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  32.53 
 
 		 706 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 632 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  27.03 
 
 		 436 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 718 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  29.36 
 
 		 582 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.06 
 
 		 810 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0312  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.542961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  36 
 
 		 636 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 612 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 750 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 927 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  31.54 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  34.74 
 
 		 979 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.14 
 
 		 733 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.07 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 649 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  29.75 
 
 		 706 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25 
 
 		 745 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 		 505 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.14 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1902  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 		 188 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2352  tetratricopeptide TPR_2  31.22 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.205488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1178 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 645 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 824 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.91 
 
 		 343 aa  43.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 361 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  27.43 
 
 		 335 aa  42.7  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  29.82 
 
 		 539 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 280 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0492  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 477 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  26.23 
 
 		 1213 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 		 471 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.82 
 
 		 282 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 878 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 269 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2749  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.29 
 
 		 610 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 		 626 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1998  uncharacterized protein involved in fimbrial biogenesis  26.32 
 
 		 267 aa  42  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.151418 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>