56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0066 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0066  hypothetical protein  100 
 
 		 566 aa  1107    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  32.2 
 
 		 571 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2535  hypothetical protein  33.74 
 
 		 554 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1261  hypothetical protein  31.89 
 
 		 576 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1102  hypothetical protein  28.7 
 
 		 542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2134  hypothetical protein  30.82 
 
 		 543 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.243617  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2326  hypothetical protein  29.84 
 
 		 546 aa  118  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  27.82 
 
 		 589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4372  hypothetical protein  30.85 
 
 		 678 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3507  membrane-like protein  26.9 
 
 		 573 aa  91.3  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.581776  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1410  membrane protein  29.71 
 
 		 621 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4864  hypothetical protein  29.39 
 
 		 556 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250978  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02587  hypothetical protein  25.94 
 
 		 541 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1048  membrane protein  26.22 
 
 		 603 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1528  membrane protein  26.22 
 
 		 603 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.721881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1504  membrane protein  25.67 
 
 		 608 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532172 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  26.62 
 
 		 603 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  26 
 
 		 596 aa  73.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  26 
 
 		 590 aa  73.9  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4832  hypothetical protein  28.77 
 
 		 672 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  33.62 
 
 		 602 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  30.74 
 
 		 626 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  32.82 
 
 		 602 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  26.47 
 
 		 596 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  32.31 
 
 		 602 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55820  hypothetical protein  28.85 
 
 		 556 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  31.79 
 
 		 602 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  31.79 
 
 		 602 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  31.79 
 
 		 602 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  31.79 
 
 		 602 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4255  putative transmembrane protein  29.44 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.179894 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4365  hypothetical protein  29.44 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.878571  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  31.56 
 
 		 595 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1283  hypothetical protein  32.6 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00406005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  33.2 
 
 		 659 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1450  hypothetical protein  30.08 
 
 		 648 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  25.62 
 
 		 542 aa  59.7  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0838  hypothetical protein  29.92 
 
 		 651 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  27.61 
 
 		 563 aa  57  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3250  membrane protein-like  31.19 
 
 		 573 aa  57  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0608  hypothetical protein  26.76 
 
 		 598 aa  55.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0969981  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2155  hypothetical protein  26.5 
 
 		 603 aa  54.3  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.0266885 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3661  hypothetical protein  24 
 
 		 575 aa  53.9  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1664  membrane protein-like protein  25 
 
 		 604 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0012251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2401  hypothetical protein  26.9 
 
 		 649 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.612705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2063  membrane protein-like protein  27.14 
 
 		 762 aa  51.2  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.537203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  31.25 
 
 		 407 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2544  hypothetical protein  26.9 
 
 		 649 aa  50.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7801  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0849  hypothetical protein  27.08 
 
 		 740 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0321  hypothetical protein  26.49 
 
 		 597 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2328  membrane protein-like protein  25.26 
 
 		 717 aa  47.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.548737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  32.59 
 
 		 298 aa  47.4  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0355  hypothetical protein  26.73 
 
 		 620 aa  47.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1698  hypothetical protein  26.73 
 
 		 620 aa  47.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1502  hypothetical protein  26.73 
 
 		 620 aa  47.4  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  38.46 
 
 		 412 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>