260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0040 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0040  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 215 aa  423  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1867  dethiobiotin synthase  49.03 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  46.48 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  49.5 
 
 		 223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1345  dethiobiotin synthase  41.83 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.408659  normal  0.0545266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2287  dethiobiotin synthase  48.62 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5169  dethiobiotin synthase  48.42 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456743  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6356  dethiobiotin synthase  47.96 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2332  dethiobiotin synthase  48.62 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2611  dethiobiotin synthase  47.71 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0738  dethiobiotin synthase  47.28 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.232851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2876  dethiobiotin synthase  42.25 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0888  dethiobiotin synthase  33.66 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1110  dethiobiotin synthetase  31.19 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.588199  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  38.04 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  30.57 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2977  dethiobiotin synthetase  34.5 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  31.09 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  37.43 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  32.65 
 
 		 228 aa  91.7  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  33.64 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  33.66 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  36 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  33.54 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  36 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2663  dethiobiotin synthase  33.83 
 
 		 238 aa  85.1  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265102  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  35.15 
 
 		 220 aa  85.1  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  35.33 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  31.48 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  28.78 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  31.22 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  32.52 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  34.93 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  37.38 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  33.8 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  36.36 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  32.37 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  36.32 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  31.11 
 
 		 646 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36.56 
 
 		 708 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  36.32 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  37.8 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  37.8 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  33.49 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  32.72 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  31.29 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  34.78 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  30.86 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  33.01 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  37.22 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  33.97 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  30.19 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  36.63 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  33.97 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  32.04 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  35.37 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  31.48 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  32.21 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  38.04 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  30.39 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  32.47 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  32.47 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  29.61 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  32.06 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  32.06 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  30.41 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  25.87 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  30.81 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  30.62 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  29.35 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  34.52 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  34.97 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  36.63 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  35.37 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  33.85 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  37.58 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  34.78 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  35.55 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  32.39 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  27.49 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  32.34 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05390  dethiobiotin synthetase  31.63 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  31.28 
 
 		 474 aa  72  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  34.09 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0517  dethiobiotin synthase  26.86 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  31.43 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  31.43 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  37.57 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  35.8 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  28.84 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  31.43 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  33.5 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  31.43 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  31.76 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  30.58 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  30.41 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  34.81 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  29.12 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  33.67 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  35.33 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>