25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0023 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0023  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  773    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00775976  normal  0.0839132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0512  hypothetical protein  68.52 
 
 
369 aa  542  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0139  hypothetical protein  65.6 
 
 
374 aa  504  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0837482  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3268  hypothetical protein  63.54 
 
 
378 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29844  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4771  hypothetical protein  34.67 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1630  hypothetical protein  29.62 
 
 
363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.434731  normal  0.391469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1622  hypothetical protein  25.9 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486775  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0542  hypothetical protein  26.42 
 
 
360 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3279  hypothetical protein  27.57 
 
 
372 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.579337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3229  hypothetical protein  32.49 
 
 
408 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0914221  normal  0.650487 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7420  hypothetical protein  27.68 
 
 
327 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213763  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2885  hypothetical protein  28.28 
 
 
327 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0711  hypothetical protein  28.28 
 
 
306 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0529754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0544  hypothetical protein  28.28 
 
 
327 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0526  hypothetical protein  28.28 
 
 
327 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1457  hypothetical protein  28.28 
 
 
327 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0131  hypothetical protein  28.28 
 
 
327 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.926446  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6141  hypothetical protein  27.71 
 
 
327 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.788729  normal  0.0942958 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6502  hypothetical protein  27.68 
 
 
327 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.564753 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6011  hypothetical protein  27.38 
 
 
327 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102541  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5646  hypothetical protein  27.38 
 
 
327 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0406823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6522  hypothetical protein  28.17 
 
 
371 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1399  hypothetical protein  28.25 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2831  hypothetical protein  29 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79276  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3501  hypothetical protein  26.74 
 
 
430 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828699  hitchhiker  0.00506138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>