More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_2013 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  100 
 
 
256 aa  505  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  98.05 
 
 
256 aa  495  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  70.7 
 
 
256 aa  373  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  67.58 
 
 
256 aa  358  4e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  53.31 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  29.45 
 
 
290 aa  123  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
289 aa  123  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  33.78 
 
 
260 aa  122  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  30.93 
 
 
242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.71 
 
 
249 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 
256 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  33.95 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.17 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.41 
 
 
260 aa  105  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.86 
 
 
250 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 
270 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  29.63 
 
 
261 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.73 
 
 
255 aa  104  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  29.02 
 
 
264 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  32.6 
 
 
284 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 
254 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 
256 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.97 
 
 
249 aa  102  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.71 
 
 
264 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 
278 aa  101  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.36 
 
 
254 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  30 
 
 
241 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 
255 aa  99.4  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 
251 aa  99  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  30.28 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 
293 aa  96.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  27.35 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 
288 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  28.14 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.09 
 
 
253 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.77 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 
277 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.78 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.77 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.22 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.77 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.98 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 
263 aa  89.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.99 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  31.44 
 
 
275 aa  89  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
278 aa  89  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  26.52 
 
 
276 aa  89  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 
280 aa  87.8  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  31.7 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  27.48 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 
293 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 
258 aa  85.9  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 
260 aa  85.9  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 
297 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 
297 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 
289 aa  85.5  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  26.91 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  29.37 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  28.51 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  31.31 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  31.48 
 
 
263 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  31.39 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  30.59 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  24.39 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  28.88 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  28.44 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
290 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  30.62 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  29.02 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  28.64 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  29.02 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1945  ABC-2 type transporter  30.7 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0850168  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  29.02 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2149  ABC-2 type transport system permease protein  30.33 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>