More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1823 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1823  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
234 aa  476  1e-133  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00210636  hitchhiker  0.000000000367552 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1295  TatD-related deoxyribonuclease  95.3 
 
 
234 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2071  TatD-related deoxyribonuclease  78.97 
 
 
234 aa  398  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.270704  normal  0.0636834 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1025  TatD-related deoxyribonuclease  79.83 
 
 
236 aa  395  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609004 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1308  TatD-related deoxyribonuclease  44.73 
 
 
237 aa  227  1e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.700571  normal  0.456144 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0199  TatD-related deoxyribonuclease  38.75 
 
 
242 aa  170  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1779  TatD-related deoxyribonuclease  39.21 
 
 
228 aa  154  8e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1998  TatD-related deoxyribonuclease  39.91 
 
 
232 aa  149  5e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  30 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2067  TatD-related deoxyribonuclease  31.17 
 
 
252 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  28.74 
 
 
266 aa  106  3e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  31.37 
 
 
255 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  33.18 
 
 
253 aa  105  7e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  31.52 
 
 
264 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  30.31 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  29.18 
 
 
263 aa  95.5  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  28.85 
 
 
256 aa  95.1  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  32.86 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  33.33 
 
 
261 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  28.06 
 
 
256 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0817  TatD family hydrolase  28.63 
 
 
251 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.240566  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  28.64 
 
 
251 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  29.32 
 
 
263 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  31.37 
 
 
462 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  31.56 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  28.79 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  26.09 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  32.68 
 
 
258 aa  91.7  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0231  putative deoxyribonuclease, TatD family  26.8 
 
 
254 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0006  TatD family hydrolase  28.92 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.637647  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1100  TatD family hydrolase  29.03 
 
 
251 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.162868  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  28.35 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  29.41 
 
 
458 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0883  TatD family hydrolase  28.16 
 
 
253 aa  89.4  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  31.77 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  26.98 
 
 
256 aa  89  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  25.48 
 
 
262 aa  89  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  30 
 
 
265 aa  89  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  29.02 
 
 
458 aa  88.6  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2878  TatD-related deoxyribonuclease  33.16 
 
 
246 aa  89  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.341938  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  30.05 
 
 
265 aa  88.6  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  30.05 
 
 
265 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  30.05 
 
 
265 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2501  putative metallodependent hydrolase  30.05 
 
 
265 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0673622  unclonable  0.0000000127791 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01104  hypothetical protein  30.05 
 
 
265 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0293758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1222  putative metallodependent hydrolase  30.05 
 
 
265 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128858  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  30.05 
 
 
265 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  27.27 
 
 
255 aa  88.2  9e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  30.05 
 
 
265 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  30.05 
 
 
265 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  27.27 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  27.27 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  28 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  30.94 
 
 
457 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  26.59 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  25.3 
 
 
255 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  29.95 
 
 
254 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  29.56 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  33.85 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0238  putative deoxyribonuclease, TatD family  26.27 
 
 
254 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0198  TatD-related deoxyribonuclease  26.8 
 
 
260 aa  86.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.865826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0202  TatD-related deoxyribonuclease  26.1 
 
 
260 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  28.32 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  30.53 
 
 
464 aa  86.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0237  TatD family deoxyribonuclease  26.48 
 
 
265 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108192  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1431  TatD-related deoxyribonuclease  27.54 
 
 
272 aa  86.3  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  33.93 
 
 
257 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  29.96 
 
 
260 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  27.94 
 
 
271 aa  85.5  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  28.69 
 
 
271 aa  85.5  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3632  hydrolase, TatD family  29.48 
 
 
262 aa  85.5  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5088  putative deoxyribonuclease, TatD family  26.67 
 
 
254 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.279248  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  30.49 
 
 
606 aa  85.1  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  26.91 
 
 
256 aa  85.1  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 
306 aa  85.1  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  29.09 
 
 
259 aa  85.1  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  29.69 
 
 
260 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  32.5 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  27.73 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  28.05 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  29.5 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  32.99 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  28.29 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  29.96 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0212  TatD family deoxyribonuclease  26.4 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0256  putative deoxyribonuclease, TatD family  26.48 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  27.91 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  28.29 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  32.14 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0222  TatD family deoxyribonuclease  26.4 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  29.74 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  31.27 
 
 
462 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  29.63 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  27.73 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  35.37 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  28.85 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  26.48 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  32.14 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  28.85 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  28.85 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>