62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1798 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1798  50S ribosomal protein L23P  100 
 
 
81 aa  159  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.217622  normal  0.590833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1585  50S ribosomal protein L23P  85.19 
 
 
81 aa  141  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0815  50S ribosomal protein L23P  82.72 
 
 
81 aa  135  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2048  50S ribosomal protein L23P  79.01 
 
 
82 aa  133  7e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.700766 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0315  ribosomal protein L25/L23  59.26 
 
 
86 aa  90.9  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.997937  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0228  ribosomal protein L25/L23  57.33 
 
 
90 aa  89  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0093  50S ribosomal protein L23P  53.09 
 
 
81 aa  88.2  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  2.49681e-09  unclonable  3.35999e-07 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0859  50S ribosomal protein L23P  48.75 
 
 
86 aa  82.4  2e-15  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.455359  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0805  50S ribosomal protein L23P  43.75 
 
 
86 aa  78.2  4e-14  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.720418  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1125  50S ribosomal protein L23P  45 
 
 
86 aa  77  9e-14  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0793  50S ribosomal protein L23P  45 
 
 
86 aa  75.5  2e-13  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.110307  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0031  50S ribosomal protein L23P  45 
 
 
86 aa  75.1  3e-13  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1519  ribosomal protein L23  54.67 
 
 
87 aa  75.1  3e-13  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  2.62554e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1726  ribosomal protein L25/L23  45.68 
 
 
82 aa  70.5  9e-12  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16602  Ribosomal protein L23a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.51 
 
 
121 aa  69.7  1e-11  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1776  ribosomal protein L23  49.38 
 
 
81 aa  67.8  6e-11  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0212  ribosomal protein L23  40.74 
 
 
84 aa  64.7  5e-10  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00350  ribosomal protein, putative  36.25 
 
 
154 aa  63.9  8e-10  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0534  50S ribosomal protein L23P  41.25 
 
 
83 aa  63.2  1e-09  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.646212  normal  0.481774 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2220  ribosomal protein L23  38.27 
 
 
84 aa  62.4  2e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2447  50S ribosomal protein L23P  37.04 
 
 
84 aa  62  3e-09  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1830  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 
85 aa  60.5  9e-09  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.649517 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0807  50S ribosomal protein L25/L23  45.33 
 
 
88 aa  59.7  1e-08  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.563432 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0444  50S ribosomal protein L23P  40 
 
 
82 aa  60.1  1e-08  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0443463  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0566  50S ribosomal protein L23P  38.27 
 
 
82 aa  59.3  2e-08  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0431079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2251  50S ribosomal protein L23P  37.84 
 
 
82 aa  57.4  7e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  2.99035e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61259  predicted protein  38.16 
 
 
139 aa  55.8  2e-07  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08856  60S ribosomal protein L23 (AFU_orthologue; AFUA_5G05630)  37.31 
 
 
153 aa  52.4  2e-06  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0108  50S ribosomal protein L23P  34.67 
 
 
82 aa  52.4  2e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0083  50S ribosomal protein L23P  31.58 
 
 
82 aa  51.6  4e-06  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.657611  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2294  50S ribosomal protein L23P  34.67 
 
 
87 aa  50.8  6e-06  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0003  50S ribosomal protein L23P  34.67 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  3.37619e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  49.12 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  49.12 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  49.12 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  47.37 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  40.35 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  49.12 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  38.46 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  40.35 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  39.29 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  39.29 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.23409e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  43.86 
 
 
98 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  38.55 
 
 
93 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  37.74 
 
 
96 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  45.61 
 
 
98 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  40.32 
 
 
99 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  8.28313e-06  decreased coverage  1.12275e-05 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  43.86 
 
 
98 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  36.62 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  35.48 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  40.7 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  43.08 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  6.05336e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  45.61 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  44.23 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  41.51 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  41.51 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1718  50S ribosomal protein L23  36.26 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0786377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0363  50S ribosomal protein L23  36.26 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.674139  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  40.35 
 
 
99 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 
99 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>