More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1711 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  77.09 
 
 
411 aa  665    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  80.3 
 
 
408 aa  682    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
408 aa  820    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  74.94 
 
 
408 aa  652    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  44.44 
 
 
412 aa  320  3e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  44.19 
 
 
415 aa  315  6e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  39.85 
 
 
404 aa  295  8e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  42 
 
 
407 aa  295  9e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  39.9 
 
 
405 aa  280  5e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  41.4 
 
 
408 aa  277  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  39.75 
 
 
412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  38.96 
 
 
413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  40.66 
 
 
404 aa  271  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  40.56 
 
 
388 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  37.92 
 
 
414 aa  268  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  38.83 
 
 
414 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  37.62 
 
 
413 aa  265  8e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  37.82 
 
 
404 aa  263  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  38.89 
 
 
409 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  36.56 
 
 
419 aa  261  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  38.01 
 
 
408 aa  260  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  38.11 
 
 
414 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  38.59 
 
 
414 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  37.59 
 
 
408 aa  256  6e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  38.29 
 
 
409 aa  253  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  37.47 
 
 
407 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  37.34 
 
 
407 aa  238  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3795  Phosphoglycerate kinase  35.94 
 
 
402 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  34.65 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0534  Phosphoglycerate kinase  34.5 
 
 
405 aa  204  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70067  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  32.66 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  35.34 
 
 
395 aa  193  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  32.84 
 
 
389 aa  193  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  35.56 
 
 
655 aa  192  8e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  33.08 
 
 
398 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  30.89 
 
 
392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  35.34 
 
 
395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  32.99 
 
 
394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  34.84 
 
 
395 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  34.34 
 
 
402 aa  189  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  33.33 
 
 
394 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3335  phosphoglycerate kinase  34.48 
 
 
397 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515635 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0739  phosphoglycerate kinase  34.01 
 
 
395 aa  187  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000102804  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0778  phosphoglycerate kinase  33.82 
 
 
405 aa  184  3e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000119701  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  32.51 
 
 
403 aa  183  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  33 
 
 
396 aa  183  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  31.81 
 
 
394 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  32.91 
 
 
400 aa  182  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03315  phosphoglycerate kinase  32.58 
 
 
420 aa  182  9.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  33.42 
 
 
394 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  28.61 
 
 
394 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  31.06 
 
 
646 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0879  Phosphoglycerate kinase  32.43 
 
 
393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.436803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  32.84 
 
 
396 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  30.98 
 
 
399 aa  180  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  31.04 
 
 
393 aa  179  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  32.41 
 
 
398 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07140  phosphoglycerate kinase  31.57 
 
 
398 aa  177  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.954732  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1248  phosphoglycerate kinase  32.91 
 
 
400 aa  177  3e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00549877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  31.06 
 
 
393 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0515  phosphoglycerate kinase  31.9 
 
 
399 aa  177  4e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.18653  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  31.55 
 
 
393 aa  177  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  32.37 
 
 
399 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  33.67 
 
 
399 aa  176  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  33.42 
 
 
399 aa  176  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0754  phosphoglycerate kinase  30.64 
 
 
391 aa  176  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.729853  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  30.3 
 
 
399 aa  176  9e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  30.4 
 
 
397 aa  176  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3076  phosphoglycerate kinase  31.36 
 
 
396 aa  176  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  31.86 
 
 
396 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1167  phosphoglycerate kinase  29.83 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  33.25 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  33.08 
 
 
654 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1085  phosphoglycerate kinase  30.15 
 
 
391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00353094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  30.77 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  30.96 
 
 
394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  32.5 
 
 
395 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  31.91 
 
 
407 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  31.62 
 
 
396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3709  phosphoglycerate kinase  32.41 
 
 
402 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  30.2 
 
 
396 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  30.2 
 
 
396 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3127  Phosphoglycerate kinase  32.59 
 
 
395 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  31.47 
 
 
394 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  32.17 
 
 
441 aa  172  9e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  31.9 
 
 
396 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0152  phosphoglycerate kinase  32.69 
 
 
396 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2283  Phosphoglycerate kinase  30.79 
 
 
407 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.836007 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  31.95 
 
 
402 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  30.52 
 
 
393 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1428  phosphoglycerate kinase  31.1 
 
 
401 aa  172  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2388  Phosphoglycerate kinase  30.71 
 
 
392 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  31.68 
 
 
402 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  31.75 
 
 
412 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  31.05 
 
 
401 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  30.83 
 
 
398 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  30.69 
 
 
392 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  31.22 
 
 
394 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  31.22 
 
 
394 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  30.12 
 
 
401 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>