More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1646 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  73.85 
 
 
652 aa  976    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  70.92 
 
 
650 aa  941    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 
654 aa  1306    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  71.19 
 
 
647 aa  938    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  55.84 
 
 
886 aa  279  1e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  42.74 
 
 
630 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  38.03 
 
 
444 aa  237  6e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 
551 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  38.29 
 
 
451 aa  226  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  33.82 
 
 
531 aa  225  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  36.39 
 
 
443 aa  223  7e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  33.17 
 
 
466 aa  212  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  36.13 
 
 
499 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  32.85 
 
 
466 aa  207  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  31.91 
 
 
449 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  32.05 
 
 
494 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  31.21 
 
 
509 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  30.98 
 
 
509 aa  197  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  34.02 
 
 
468 aa  193  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  32.7 
 
 
444 aa  192  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  33.59 
 
 
590 aa  187  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  33.25 
 
 
491 aa  186  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  33.76 
 
 
517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  32.9 
 
 
479 aa  177  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  33 
 
 
488 aa  177  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 
531 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  31.05 
 
 
440 aa  173  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  31.82 
 
 
462 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  29.82 
 
 
479 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  31.13 
 
 
479 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  31.54 
 
 
479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  35.45 
 
 
456 aa  164  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  31.3 
 
 
551 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  29.43 
 
 
479 aa  163  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  33 
 
 
451 aa  162  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  33.16 
 
 
479 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  31.07 
 
 
485 aa  161  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  31.66 
 
 
485 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  31.01 
 
 
463 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  35.6 
 
 
451 aa  159  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  33.59 
 
 
470 aa  159  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  29.95 
 
 
548 aa  159  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  34.2 
 
 
451 aa  158  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.34 
 
 
555 aa  157  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.67 
 
 
550 aa  156  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  30.53 
 
 
550 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  30.03 
 
 
551 aa  153  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.79 
 
 
558 aa  153  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  28.84 
 
 
558 aa  153  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  31.44 
 
 
558 aa  152  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  33.86 
 
 
649 aa  152  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  32.8 
 
 
666 aa  151  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  29.86 
 
 
548 aa  151  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  30.3 
 
 
548 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  30.28 
 
 
548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  29.8 
 
 
602 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  29.71 
 
 
557 aa  148  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  30.52 
 
 
546 aa  147  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  31.38 
 
 
630 aa  146  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  29.26 
 
 
549 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  32.22 
 
 
559 aa  143  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  30.28 
 
 
561 aa  143  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  28.61 
 
 
548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  29.72 
 
 
554 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  25.65 
 
 
564 aa  139  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  31.58 
 
 
581 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  32.04 
 
 
548 aa  138  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  29.49 
 
 
385 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  29.19 
 
 
455 aa  137  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  31.11 
 
 
951 aa  136  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  30.03 
 
 
555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.5 
 
 
548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  29.54 
 
 
590 aa  135  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  32.02 
 
 
658 aa  134  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  29.87 
 
 
556 aa  134  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  30.53 
 
 
545 aa  133  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  28.83 
 
 
549 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  28.83 
 
 
549 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  28.83 
 
 
549 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  25.87 
 
 
464 aa  132  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  29.08 
 
 
549 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  28.71 
 
 
550 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  29.34 
 
 
549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  28.75 
 
 
542 aa  128  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  29.95 
 
 
545 aa  125  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.4 
 
 
633 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  25.69 
 
 
866 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  28.54 
 
 
696 aa  116  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  27.57 
 
 
809 aa  114  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  27.57 
 
 
809 aa  114  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  26.98 
 
 
493 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  27.89 
 
 
796 aa  112  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  24.57 
 
 
838 aa  112  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  25.98 
 
 
698 aa  110  6e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  28.5 
 
 
706 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  24.68 
 
 
818 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  26.4 
 
 
489 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  28.54 
 
 
492 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  26.4 
 
 
489 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  26.16 
 
 
998 aa  108  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>