More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1490 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  97.32 
 
 
411 aa  828    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000639635 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
413 aa  850    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.245536  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.06 
 
 
409 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0896944  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.24 
 
 
417 aa  521  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0350628  normal  0.478432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  34.41 
 
 
342 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0340  GDP-mannose 4,6-dehydratase  31.52 
 
 
350 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000850961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.44 
 
 
324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  33.9 
 
 
327 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  35.37 
 
 
329 aa  162  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.63 
 
 
322 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017259  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1704  GDP-mannose 4,6-dehydratase  29.04 
 
 
344 aa  160  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0232343  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  30.05 
 
 
345 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  34.25 
 
 
327 aa  160  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.79 
 
 
326 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  33.9 
 
 
330 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  29.66 
 
 
368 aa  159  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2872  GDP-mannose 4,6-dehydratase  34.44 
 
 
340 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  34.02 
 
 
321 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2297  GDP-D-mannose dehydratase, putative  36.88 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1069  putative GDP-D-mannose dehydratase  36.88 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3279  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  36.88 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.409914  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3293  WcbK  36.88 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0531  putative GDP-D-mannose dehydratase  36.88 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.212911  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2175  putative GDP-D-mannose dehydratase  36.88 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3742  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.45 
 
 
320 aa  156  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  33.56 
 
 
324 aa  156  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  29.23 
 
 
364 aa  155  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.05 
 
 
319 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1316  GDP-mannose 4,6-dehydratase  29.48 
 
 
367 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1249  GDP-mannose 4,6-dehydratase  30.92 
 
 
355 aa  155  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3269  GDP-mannose 4,6-dehydratase  30.55 
 
 
383 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  31.97 
 
 
368 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0690  GDP-mannose 4,6-dehydratase  29.07 
 
 
347 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00490394  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3244  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  37.19 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  34.47 
 
 
323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0917  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.45 
 
 
334 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  31.17 
 
 
362 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2890  GDP-mannose 4,6-dehydratase  27.94 
 
 
343 aa  153  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.657822  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3292  GDP-mannose 4,6-dehydratase  27.94 
 
 
343 aa  153  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.694312  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2977  GDP-mannose 4,6-dehydratase  27.94 
 
 
339 aa  153  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2592  GDP-mannose 4,6-dehydratase  27.94 
 
 
339 aa  153  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2901  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.47 
 
 
361 aa  153  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2694  GDP-mannose 4,6-dehydratase  30.59 
 
 
401 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.093727 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20961  GDP-D-mannose dehydratase  28.87 
 
 
350 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  32.77 
 
 
327 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6329  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.96 
 
 
354 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2295  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.82 
 
 
347 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0502351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.66 
 
 
319 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3954  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.78 
 
 
370 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  34.81 
 
 
328 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1482  GDP-mannose 4,6-dehydratase  30.14 
 
 
373 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246967  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71990  GDP-mannose 4,6-dehydratase  35.11 
 
 
323 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1868  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.82 
 
 
347 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350001  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1709  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.82 
 
 
347 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0269381  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2115  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.11 
 
 
348 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1680  GDP-mannose 4,6-dehydratase  27.71 
 
 
344 aa  151  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1660  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.82 
 
 
347 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4139  GDP-mannose 4,6-dehydratase  30.2 
 
 
354 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.927486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2622  GDP-mannose 4,6-dehydratase  32.4 
 
 
344 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207032  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0540  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.82 
 
 
347 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.647987  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2434  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.82 
 
 
347 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186201  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00720  GDP-mannose 4,6-dehydratase  32.3 
 
 
331 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.240367 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.79 
 
 
342 aa  150  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0174  GDP-mannose 4,6-dehydratase  30.1 
 
 
373 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.338951  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1923  GDP-mannose 4,6-dehydratase  29.76 
 
 
359 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.578659  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3411  GDP-mannose 4,6-dehydratase  30.15 
 
 
335 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0492  GDP-mannose 4,6-dehydratase  27.96 
 
 
344 aa  150  6e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3559  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.36 
 
 
348 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0335248  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4397  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.36 
 
 
348 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3970  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.36 
 
 
348 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122884  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  34.02 
 
 
328 aa  150  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  34.73 
 
 
323 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0758  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.57 
 
 
347 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627474  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1429  GDP-mannose 4,6-dehydratase  30.17 
 
 
369 aa  149  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  33.22 
 
 
324 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0425  GDP-mannose 4,6-dehydratase  29.43 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  30.5 
 
 
361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4012  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.72 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.09 
 
 
321 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033551  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  29.24 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.71 
 
 
363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  27.78 
 
 
343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.11 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879039  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3277  GDP-mannose 4,6-dehydratase  27.64 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1221  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.54 
 
 
355 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.155645  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3358  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.11 
 
 
348 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591242  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4612  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.46 
 
 
347 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.714119  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  29.56 
 
 
353 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2667  GDP-mannose 4,6-dehydratase  29.68 
 
 
373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1491  GDP-mannose 4,6-dehydratase  30.17 
 
 
360 aa  146  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  27.61 
 
 
355 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_002950  PG1288  GDP-mannose 4,6-dehydratase  29.79 
 
 
361 aa  146  6e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5682  GDP-mannose 4,6-dehydratase  33.71 
 
 
323 aa  146  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  29.6 
 
 
373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  34.03 
 
 
334 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0773  GDP-mannose 4,6-dehydratase  29.93 
 
 
360 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0432  GDP-mannose 4,6-dehydratase  27.99 
 
 
382 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1069  GDP-mannose 4,6-dehydratase  28.61 
 
 
347 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.390497 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25417  gdp-mannose 4,6-dehydratase  28.47 
 
 
363 aa  145  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.807653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  29.5 
 
 
375 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.179756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>