More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1225 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  100 
 
 
127 aa  254  4e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  76.38 
 
 
127 aa  206  1e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  68.75 
 
 
128 aa  192  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0173  signal-transduction protein  70.08 
 
 
130 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  42.4 
 
 
138 aa  88.2  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  38.98 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  37.19 
 
 
131 aa  84.7  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  41.8 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  42.02 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  38.66 
 
 
135 aa  84  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.97 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  36.97 
 
 
160 aa  82  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  43.62 
 
 
688 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  41.27 
 
 
136 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  41.67 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  44.68 
 
 
688 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  41.67 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  36.3 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  40 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  39.32 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  40.52 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
688 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  37.82 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  36.97 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  36.97 
 
 
144 aa  77  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  44.9 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  38.84 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  37.19 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  36.04 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  37.93 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  40 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  39.23 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  32.23 
 
 
641 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  38.98 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  35.83 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  36.07 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  37.74 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  38.21 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2400  CBS domain containing protein  39.42 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190312  decreased coverage  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  32.8 
 
 
623 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  38.79 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  42.86 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.44 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  33.9 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  33.02 
 
 
646 aa  70.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 
643 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  36.15 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  37.74 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  36.89 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  36.11 
 
 
638 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  34.75 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3097  hypothetical protein  36.64 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  36.29 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  34.71 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  39.81 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  34.78 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  39.09 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  36.51 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  40.45 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  33.9 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  36.75 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0768  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.91 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000458984  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  34.62 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  28.15 
 
 
639 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  33.06 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  33.88 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1844  hypothetical protein  36.7 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.88 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  32.26 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  36.51 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  31.67 
 
 
315 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  35 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  31.67 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1245  signal-transduction protein  31.85 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  29.06 
 
 
646 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  31.45 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2638  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  31.93 
 
 
615 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36 
 
 
606 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  32.48 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  33.88 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1660  CBS domain containing protein  29.55 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0113728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1990  CBS domain containing protein  29.55 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 
615 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  30.4 
 
 
626 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1806  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.04 
 
 
574 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55767  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  35 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0184  putative signal transduction protein with CBS domains  30.4 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  39.13 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  31.93 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  31.4 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2287  CBS domain containing protein  31.93 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332436  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  36.17 
 
 
174 aa  62  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  31.03 
 
 
492 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  31.58 
 
 
412 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 
645 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 
165 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1251  signal-transduction protein  33.62 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.904359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>