20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1146 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0099  hypothetical protein  72.92 
 
 
435 aa  650    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.428389  decreased coverage  0.00133655 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1146  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  891    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000092529 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0072  hypothetical protein  70.74 
 
 
438 aa  667    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0107  hypothetical protein  73.39 
 
 
436 aa  682    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0931  aminopeptidase  31.89 
 
 
539 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0562565  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1783  conserved hypothetical protein  27.7 
 
 
488 aa  113  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  27.53 
 
 
454 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  30.77 
 
 
481 aa  50.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  27.75 
 
 
468 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  28.57 
 
 
468 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  29.56 
 
 
468 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  28.27 
 
 
469 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  30.89 
 
 
477 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  27.23 
 
 
468 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1393  peptidase M28  23.78 
 
 
361 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0177008  unclonable  0.000000310034 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0086  aminopeptidase  23.83 
 
 
434 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0111442  hitchhiker  0.0000071727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  27.75 
 
 
468 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  27.75 
 
 
468 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  24.01 
 
 
459 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  26.7 
 
 
468 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>